散囊菌目Eurotiales物种具有重要的工业、农业、生态和医药价值。本研究从我国广东省分离得到一株该目真菌XCW_SN069，为了确定其准确的分类地位，利用高通量测序技术测定了其全基因组序列。又从公共数据库获取了该目大团囊菌科Elaphomycetaceae 2个基因组和爪甲团囊菌目Onygenales 2个基因组用以比较分析。从这些基因组中，提取了9个基因片段，包括核糖体DNA转录间隔区(ITS)、大亚基(28S)、小亚基(18S)、RNA聚合酶Ⅱ第二大亚基(RPB2)、第一大亚基(RPB1)、TCP-1伴侣蛋白复合体第8亚基(Cct8)、推定核糖体生物合成蛋白(Tsr1)、β微管蛋白(BenA)和钙调蛋白(CaM)。结合基因组提取数据与已发表研究数据，我们构建了散囊菌目9基因单独或联合数据组，涵盖了该目已知的全部5科27属。经过系统发育分析发现，菌株XCW_SN069代表了该目一个未描述的新种——中国南方菌Austromyces sinicus、新属——南方菌属Austromyces和新科——南方菌科Austromycetaceae，其在9基因联合系统发育树上与大团囊菌科关系最近。同时，研究还发现，嗜热子囊菌科Thermoascaceae的原有概念没有获得本研究支持，而原隶属于该科的拟青霉属Paecilomyces应独立成为一个新科——拟青霉科Paecilomycetaceae。因此，散囊菌目的分类系统被修订为包含7个科，即曲霉科Aspergillaceae、南方菌科、大团囊菌科、拟青霉科、异青霉科Penicillaginaceae、嗜热子囊菌科和发菌科Trichocomaceae。本文提供了中国南方菌的详细描述与图示，并对散囊菌目中的高阶分类单元进行了评述。
小塔氏菌属Tapinella隶属于担子菌门，牛肝菌目，小塔氏菌科，是引起木材褐腐的重要真菌类群，全球已知种类稀少，主要分布于北半球温带地区。本研究基于形态学特征及多基因(ITS、nrLSU、tef1-α、rpb1)联合系统发育分析，描述了采自湖北省竹山县竹林生境的小塔氏菌属一新种——竹生小塔氏菌Tapinella bambusicola。该种主要鉴别特征为：子实体大型，菌盖直径98-133 mm，扇形至近漏斗状；菌柄偏生，密被栗褐色至黑褐色绒毛；担孢子卵圆或椭圆形至宽椭圆形(5.0-6.0 × 3.5-4.0 μm)；褶缘囊状体丰富，棒状至不规则棒状，或纺锤形(18-33 × 3.0-6.5 μm)；腐生于竹林腐木及枯枝落叶层。系统发育分析表明，新种与黑毛小塔氏菌T. atrotomentosa形成姐妹群关系(ML/BI = 100/1.00)。种间遗传距离(ITS: 0.021 4; nrLSU: 0.010 0; tef1-α: 0.033 8; rpb1: 0.023 6)显著大于种内遗传距离(0.000 8-0.011 1)，支持其独立种地位。新种可通过菌盖明显较大(98-133 mm vs. 40-50 mm)、具丰富褶缘囊状体(vs.缺失)及竹林腐生习性(vs.松属倒木)与T. atrotomentosa明确区分。本研究记录了小塔氏菌属在竹林生态系统中的新种成员，拓展了该属已知的基质适应范围，为竹林真菌多样性研究提供了新材料。
木生真菌是一类具有重要生态功能和经济价值的大型真菌。我国森林资源丰富，且火烧迹地这种特殊生境又为木生真菌提供了独特的生长基质。我国过去对火烧迹地木生真菌的研究相对薄弱，作者对全国主要火烧迹地的木生真菌资源进行了系统调查，并结合国内主要标本馆保藏的相关标本系统整理了木生真菌347种，隶属于担子菌门的3纲16目89科190属，本研究首次报道了99种在火烧迹地中发现的木生真菌。其中优势目是多孔菌目、蘑菇目和锈革孔菌目，优势目的物种数量总计占比66.29%；优势科为多孔菌科Polyporaceae、锈革孔菌科Hymenochaetaceae和拟层孔菌科Fomitopsidaceae，优势科的物种数占比19.88%。优势属为木孔菌属Xylodon、射脉菌属Phlebia、栓孔菌属Trametes、齿耳菌属Steccherinum、裸伞属Gymnopilus、小菇属Mycena、鳞伞属Pholiota、黑耳属Exidia、黏褶菌属Gloeophyllum、木层孔菌属Phellinus、干皮孔菌属Skeletocutis、拟蜡卧孔菌属Ceriporiopsis、原毛平革菌属Phanerochaete、隔孢伏革菌属Peniophora和糙孢菌属Trechispora，优势属的物种占总物种数量的23.92%。
贵阳市地处黔中山原丘陵中部，长江与珠江分水岭地带，属于亚热带湿润温和型气候，其森林覆盖率高达55%，为大型真菌的理想栖息地，但该市的大型真菌物种多样性本底数据长期缺乏系统梳理。本研究基于2019至2025年研究团队采集的标本数据，汇编贵阳市大型真菌物种名录。结果表明该市大型真菌种类578种，约250种是首次记录，隶属2门9纲24目103科262属，包括子囊菌32种，担子菌546种。优势目为蘑菇目Agaricales、多孔菌目Polyporales、红菇目Russulales。优势科为红菇科Russulaceae、多孔菌科Polyporaceae、蘑菇科Agaricaceae、鹅膏科Amanitaceae、类脐菇科Omphalotaceae、牛肝菌科Boletaceae和小脆柄菇科Psathyrellaceae，占总科数的6.80%，总物种数的35.99%。优势属为红菇属Russula、鹅膏属Amanita、蘑菇属Agaricus、乳菇属Lactarius和小皮伞属Marasmius，占总属数的1.90%、总物种数的15.74%。在地理分布上，世界广布种和北温带分布种是该地区最常见的物种，分别含有405种和106种，分别占总数的70.07%和18.34%；资源评估显示，食用菌113种、药用菌60种、食药兼用菌37种及毒菌51种；濒危评估发现：易危物种3种、近危物种4种，占总物种的1.19%，并记录中国特有种76种。本研究揭示了贵州省贵阳市的大型真菌物种组成、资源状况和受威胁现状，为后续资源开发与利用奠定基础。
云南省文山州地处滇东南喀斯特东南季风阔叶林生物多样性保护优先区域，其地形复杂、气候立体多样，为大型真菌的生长发育提供了优越环境。本研究通过开展野外标本采集，采用形态学与分子生物学鉴定方法，对文山州大型真菌多样性、区系组成、资源价值及濒危状况进行了系统研究。共鉴定大型真菌303种，隶属于2门6纲19目68科160属，包括子囊菌18种、担子菌285种。优势科为红菇科Russulaceae、牛肝菌科Boletaceae和多孔菌科Polyporaceae，优势属包括红菇属Russula、鹅膏属Amanita和乳菇属Lactarius。区系地理成分分析表明，世界广布成分(51.82%)、泛热带成分(23.64%)和北温带成分(20.00%)为主要分布型，呈现显著的亚热带区系特征。资源评价显示，具有经济价值的大型真菌共140种，包括食用菌104种、药用菌67种、食药兼用菌45种及毒菌39种。濒危评估发现易危物种1种(干巴菌Thelephora ganbajun)、近危物种1种(杯密瑚菌Artomyces pyxidatus)，并记录中国特有种15个。研究结果揭示了文山州大型真菌的多样性与资源潜力，为该区域真菌资源保护、可持续利用及生态安全屏障建设提供了科学依据。
为明确青海省柴达木盆地“沙菇”的物种组成及其生境适应性，本研究对采自德令哈、诺木洪和乌兰地区的“沙菇”标本进行宏观形态学与分子鉴定，并对其采集环境的土壤开展理化性质分析。宏观形态学观察显示，德令哈与诺木洪样本菌盖具棕黄色细鳞，受伤后变红棕色，菌环单层厚膜质呈靴状；乌兰样本菌盖纯白光滑，受伤后呈斑块状褐变，菌环双层薄膜质。结合nrITS序列系统发育分析，这些形态存在明显差异的“沙菇”分属蘑菇属中的假包脚亚属subg. Pseudochitonia双环组sect. Bivelares的2个物种：德令哈与诺木洪的样本为中华美味蘑菇Agaricus sinodeliciosus，而乌兰的样本为大肥菇A. bitorquis。土壤理化分析进一步揭示了两种“沙菇”生境的显著差异(P<0.05)：中华美味蘑菇A. sinodeliciosus偏好相对湿润(含水量2.51%-8.06%)、肥力较高(有机质19.50-64.83 g/kg)的盐渍化土壤；大肥菇A. bitorquis适应干旱[含水量(0.90±0.58)%]、强碱性[pH (9.22±0.09)]且贫瘠[有机质(1.52±0.33) g/kg]的土壤，但其全钾含量[(22.33±0.83) g/kg]较高。本研究基于宏观形态和分子鉴定与土壤分析结果，明确青海“沙菇”的物种，并首次系统量化了两种“沙菇”的生境土壤参数，揭示了其对不同生境的差异化适应特征，为资源的保护与人工栽培提供了理论依据。
胶孢刺盘孢Colletotrichum gloeosporioides侵染引起的炭疽病是荔枝生产中的重要病害，目前以化学防治为主，随着环境污染的加剧和产生的抗药性问题，研发高效环保的生物防治技术具有重要意义。本研究从19株木霉菌中筛选出对胶孢刺盘孢有显著拮抗作用的菌株YN012，非挥发性物质、挥发性物质和发酵滤液的抑制率分别为72.96%、78.14%、98.05%。结合形态学特征和分子生物学鉴定明确了菌株YN012为棘孢木霉Trichoderma asperellum。该菌株发酵滤液对胶孢刺盘孢抑制作用更为显著，发酵滤液浓度为20%时能完全抑制分生孢子的形成，浓度为50%时对菌丝生长和分生孢子萌发的抑制率可达96%以上；菌株发酵滤液浓度为40%时，可使离体荔枝叶片和果实炭疽病的发病率降低至29.00%和25.33%。本研究结果为该木霉菌株作为荔枝炭疽病生物防治剂的开发与应用提供了理论基础和候选菌株。
本研究对15株广叶绣球菌(包括10株栽培菌株和5株野生菌株)进行系统研究，采用ITS序列进行分子鉴定以确认物种身份与遗传背景，并通过测定菌丝体生长表型与子实体农艺性状，使用方差分析、主成分分析和系统聚类分析等方法挖掘数据与综合评价。ITS序列分析确定15个供试菌株均为广叶绣球菌。表型性状分析结果表明，不同菌株在菌丝体生长表型和子实体农艺性状上存在显著差异。栽培菌株在子实体重量、生物学转化率、韧性和栽培周期等方面整体优于野生菌株，其中菌株Sl-1的子实体重量最高[(321.07±29.18) g]，菌株Sl-5的母种菌丝生长速度最快[(1.13±0.04) mm/d]，且栽培菌株子实体瓣片多为奶白色(2A2)，韧性中等或较好，栽培周期为103-125 d。野生菌株产量普遍较低，子实体瓣片颜色偏黄，韧性一般或脆质，栽培周期为108-132 d，但菌株Sl-12表现突出，其产量接近于优良栽培菌株水平且稳定性最高(变异系数为4.44%)。主成分分析提取的前3个主成分累计贡献率达82.47%，明确了不同菌株不同性状指标的主要特征与关联性。聚类分析将15个菌株分为3类，第1类群均为栽培菌株且优质高产，第2类群包括4个产量略低的栽培菌株和1个野生菌株，第3类群是菌株Sl-12为代表的野生菌株。本研究为广叶绣球菌种质创新、品种改良及产业化发展提供了科学的理论依据和数据支撑。
杨梅素(myricetin, M)作为黄酮醇类化合物，在抗氧化、抗炎及抗肿瘤方面都具有显著生物活性，但其真菌来源的完整合成途径尚未明确。本研究以六出花链格孢菌Alternaria alstroemeria ZZ-HY-03-02为研究材料，从该菌中鉴定了参与杨梅素生物合成的3个关键基因，AaCHI (查尔酮异构酶编码基因)、AaF3'5'H (类黄酮3ʹ,5ʹ-羟化酶编码基因)及AaFLS (黄酮醇合酶编码基因)。在构巢曲霉Aspergillus nidulans LO8030中异源表达3个基因，均能在异源宿主中发挥活性并激活杨梅素的合成，其中AN-AaFLS菌株杨梅素产量达(12.94±0.35) μg/L。喂养试验发现，AaFLS靶向催化二氢杨梅素(dihydromyricetin, DHM)合成杨梅素，AaCHI可催化柚皮素查尔酮(naringenin chalcone, Nar-chalcone)异构化为柚皮素(naringenin, Nar)，而相较于经典植物杨梅素合成途径，AaF3'5'H可能存在独特催化路径。代谢组学分析表明3个基因可通过介导色氨酸代谢、酪氨酸代谢等多条上游代谢通路来影响最终代谢产物的含量。该研究通过基因挖掘与异源表达技术，明确了六出花链格孢菌中杨梅素生物合成关键基因的功能，为真菌来源杨梅素的生物合成提供了理论基础和关键生物合成技术支撑。
启动子和终止子是基因功能研究中表达外源基因的关键调控元件。由于不同门类的真菌遗传差异显著，其基因表达调控元件一般仅在本物种内或相似性较高的物种之间使用。构巢曲霉是研究真菌遗传发育的模式物种，也在合成生物学研究中被广泛用于外源蛋白的表达。目前在构巢曲霉中外源基因表达主要利用自身组成型的gpd基因启动子或tef基因的启动子，通过PEG介导对原生质体进行转化。本研究我们利用农杆菌介导将一个在担子菌中使用的表达质粒P020对构巢曲霉的无性孢子进行了遗传转化。该质粒含有来源于刺芹侧耳自身启动子驱动的萎锈灵抗性基因表达框，以及斑玉蕈gpd基因启动子驱动eGFP基因表达框。来源于刺芹侧耳的萎锈灵抗性基因能够在农杆菌介导的构巢曲霉遗传转化中高效地筛选到阳性转化子，而斑玉蕈gpd基因启动子能够驱动eGFP基因在构巢曲霉菌丝中表达绿色荧光蛋白。上述研究表明来自刺芹侧耳和斑玉蕈的启动子和终止子等基因表达调控元件能在构巢曲霉中成功驱动外源基因表达并行使蛋白功能，该研究为真菌中使用远缘物种的基因表达调控元件提供了借鉴。
麦角甾醇是真菌细胞膜的重要成分，是合成多种甾体药物的关键前体，具有广泛应用价值。麦角甾醇传统生产方式会对环境造成严重污染，因此开发高效、绿色的麦角甾醇生物合成新方法具有重要意义。Erg6基因编码的甾醇C-24甲基转移酶是麦角甾醇合成途径中的关键酶，但该基因在大型真菌中对麦角甾醇的合成调控机制仍不清晰。本研究以阿魏侧耳Pleurotus eryngii var. ferulae为实验材料，成功克隆其Erg6基因。该基因全长为1 062 bp，编码354个氨基酸。构建Erg6基因过表达载体，通过农杆菌介导遗传转化法获得16株阳性转化阿魏侧耳菌株。3株转化菌株菌丝生长速度显著低于野生型菌株，液体发酵实验结果显示，有3株转化菌株液体发酵菌丝球湿重显著高于野生型菌株，其中2株转化菌株菌丝球干重也显著高于野生型菌株。实时荧光定量PCR结果表明，转化菌株中Erg6基因表达量均显著提高；高效液相色谱分析显示，有6株转化菌株的麦角甾醇含量较野生型菌株显著提高。研究表明，Erg6基因高表达可提高阿魏侧耳麦角甾醇含量，但Erg6基因表达量与麦角甾醇含量并非完全呈正相关关系，其调控机制尚需进一步研究。研究结果可为后续采用合成生物学的手段提升大型真菌中麦角甾醇产量奠定理论基础。
通过比较米曲霉单核与多核分生孢子孢内蛋白质组差异，探讨米曲霉分生孢子核数变化的响应机理，为解析不同核型孢子表型分化的分子基础提供理论依据。分别对米曲霉单核与多核分生孢子进行了孢内蛋白质双向电泳，共筛选出41个差异蛋白点，质谱鉴定后获得6种未知功能蛋白和45种已知蛋白质，其中包含热激蛋白、多种代谢酶及物质运输相关蛋白等。对差异蛋白的GO分类注释及KEGG富集分析发现，单核分生孢子通过精细化调控，优化基础代谢效率，侧重稳态维持；多核分生孢子则通过代谢协同增强能量输出，激活主动防御提升群体生态位竞争力，两者互补协同扩大米曲霉的生态适应性。实验结果为解析米曲霉环境适应性机制提供了重要线索，也为工业菌株选育及发酵过程调控提供了理论参考。
胶孢刺盘孢Colletotrichum gloeosporioides是一种寄主范围广泛的植物病原真菌，在全球范围内引起严重的炭疽病，导致农作物产量严重损失。为实现对该病原菌的快速、高效检测，本研究基于该菌的β-微管蛋白基因(TUB)，设计特异性引物Cg-tub-6F/Cg-tub-6R及CRISPR引导RNA Cg-tub-6sgRNA，构建了一种结合重组酶聚合酶等温扩增技术(RPA)、CRISPR-dCas9与侧向层析试纸条(LFA)的快速检测方法。该体系在30 min内即可完成检测，灵敏度可达3拷贝/μL。由于无需探针及额外报告分子，在信号读出环节的试剂成本方面，相较于部分依赖报告分子的CRISPR-Cas系统具有一定优势。单管闭管反应有效避免了气溶胶污染，操作简便，适用于田间、市场及实验室等多种场景下的病原菌快速检测。本方法为胶孢刺盘孢的早期诊断和精准防控提供了重要技术支撑，有助于减轻炭疽病危害、保障农业生产安全、降低由此带来的经济损失。
苜蓿轮枝菌Verticillium alfalfae 是我国进境植物检疫性有害生物，所造成的苜蓿黄萎病对国内苜蓿产业构成严重威胁。本研究基于酶介导双重指数扩增技术(enzyme mediated duplex exponential amplification, EmDEA)针对该病原菌的特异性扩增片段(sequence-characterized amplified region, SCAR)设计并筛选出特异性引物-探针组合。特异性检测结果表明，该方法能够特异性检出苜蓿轮枝菌，相近种均未检出。灵敏度检测结果表明，其最低检测限为DNA浓度10 pg/µL。模拟样品检测结果显示，该方法能够筛查检测出携带有苜蓿轮枝菌的苜蓿样品。该技术具有操作简便、耗时短、特异性强等优势，能有效应用于口岸进境植物材料中苜蓿轮枝菌的现场快速筛查。
亚沙棘嗜蓝孢孔菌Fomitiporia subhippophaeicola属于锈革孔菌科，与著名药用真菌瓦尼桑黄Sanghuangporus vaninii有较近的亲缘关系，具有潜在的药用开发前景，但该物种的驯化栽培目前还未见报道。为了扩充药用真菌资源，本研究从采自西藏的真菌子实体中单孢分离得到一个菌株ZW129，通过形态学和分子手段鉴定为亚沙棘嗜蓝孢孔菌F. subhippophaeicola，保藏号为CCTCC M20241904。以该菌株作为研究对象，进行生物学特性单因素试验、正交试验和栽培出菇试验，并实现了栽培出菇。结果揭示温度对菌丝体生长的影响最大，其次为碳源、pH和氮源，该菌株菌丝体的最适培养条件为：以玉米粉为碳源、以蛋白胨为氮源、温度28 ℃、pH 6。栽培出菇试验结果显示，28 ℃发菌约80 d，菌丝长满袋并转色；割袋后在空气湿度80%-90%，适量散射光条件下，大约6-8 d可长出原基；原基形成后约50 d子实体成熟。本研究为亚沙棘嗜蓝孢孔菌的后续开发利用提供了基础实验数据。
本研究以2株瓦尼桑黄为研究对象，利用Pearson相关性分析4种胞外酶(漆酶、淀粉酶、纤维素酶和多酚氧化酶)活性与胞外多酚含量的相关性，从中筛选出与这2株瓦尼桑黄胞外多酚积累相关性最高的均是漆酶，随后通过单因素试验和响应面法优化其液体发酵产漆酶的工艺。结果显示，瓦尼桑黄Z-0090菌株产漆酶最佳发酵条件为：葡萄糖25 g/L，蛋白胨11 g/L，KH2PO4 1.5 g/L，接种量15%，转速180 r/min，初始pH 7.0；瓦尼桑黄Z-0119菌株产漆酶最佳发酵参数为：葡萄糖26 g/L，牛肉膏10 g/L，KH2PO4+MgSO4 1.6 g/L，接种量10%，转速180 r/min，初始pH 6.0。在最佳发酵条件下，经192 h发酵，瓦尼桑黄Z-0090菌株漆酶产量为0.504 nmol/min/mL，瓦尼桑黄Z-0119菌株漆酶产量为0.409 nmol/min/mL，分别是优化前的1.87倍和2.05倍。同时，野生瓦尼桑黄菌株Z-0090菌株在液体发酵产漆酶和作为液体菌种方面有良好的应用前景。
本文对高大鹅膏Amanita princeps子实体的化学成分及其抗菌活性进行研究。采用硅胶色谱、高效液相色谱等多种柱色谱技术对高大鹅膏子实体95%乙醇提取物进行分离纯化，通过MS、NMR和电子圆二色谱鉴定化合物结构。从该菌85 g子实体的乙酸乙酯和正丁醇萃取物中分离得到12个单体化合物，分别鉴定为amanitacid A (1)、肉桂酸(2)、2,6-dichloronaphthalene (3)、2,3-dihydro-4(1H)-quinolone (4)、enniatin B (5)、enniatin H (6)、对羟基苯甲酸(7)、尿嘧啶(8)、尿嘧啶苷(9)、腺苷(10)、胸腺嘧啶(11)、transtorine (12)。其中化合物1为新化合物，通过ECD计算确定其绝对构型，化合物3为新天然产物，化合物1-12均为该菌首次分离得到。对化合物2-12进行抗菌活性测定，结果表明化合物6对大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林葡萄球菌和白色念珠菌均显示微弱抑制效果，MIC值分别为32、64、64、64和64 μg/mL。本研究首次揭示高大鹅膏化学成分结构，发现抗菌活性成分，为深入挖掘高大鹅膏抗菌药用价值提供理论依据。
肺形侧耳Pleurotus pulmonarius是商业化栽培的主要食用菌，工厂化生产中主要采用液体菌种。为制成高菌球密度的液化菌种，本研究优化固体菌种制备工艺，之后确定固体菌种液化培养适宜接种量和萌发时间，测试生长动力学及在生物反应器中评价固体菌种液化生长性能。结果表明，固体菌种最佳制备工艺为：容重0.34 g/cm3，培养料初始含水量55% (质量比)，麸皮添加量5% (质量比)，发酵温度25 ℃，培养时间15 d。优化后的固体菌种液化培养最优接种量为1.2 g/100 mL，菌球密度高，达2 585 pellets/mL。液化培养过程菌球比生长速率随时间剧烈波动，从-0.053 3至0.075/h。固体菌种液化培养8 h内可萌发。生物反应器中低接种量(2.0 g/2 L)条件下，3 d内即可制成高菌球密度液化菌种，为1 126 pellets/mL，菌球大小均一，直径1-2 mm菌球占92.46%，活力强。本研究通过优化肺形侧耳固体菌种制备工艺，液化生长性能优异，显著提高菌球数量，可为食用菌液化菌种制备提供有价值参考。
3个新品种均由系统选育育成。七妹羊肚菌‘中源1号’采自云南丽江永胜，属七妹羊肚菌，菌盖圆锥形至卵圆形，颜色浅褐色，宜采用设施大棚进行栽培，栽培周期为110 d。金顶侧耳‘德桦1号’采自西藏林芝，菌盖金黄色，浅漏斗状，边缘呈波纹状，菌柄白色，宜采用大棚码垛栽培或覆土地栽，栽培周期36.83 d。肺形侧耳‘云秀珍1号’采自云南怒江贡山，菌盖扁半球形至平展，灰白色，边缘平滑或稍呈波状，菌褶白色，菌柄短，宜采用工厂化设施栽培，栽培周期28.38 d。
