特应性皮炎(Atopic dermatitis, AD)是一种慢性炎症性皮肤病，具有湿疹的特定临床表现，伴有严重的瘙痒和搔抓，这可导致皮肤屏障破坏，继而诱发微生物感染。由于对真菌感染多样性的认识不足，对AD发生和发展过程中真菌感染的临床表现以及不同的药物治疗缺乏全面的了解，这可能会导致误诊、漏诊不正确的治疗方法。本文系统总结了AD患者发生的皮肤真菌感染的病原体的种类，包括马拉色菌属、毛癣菌属、念珠菌属等常见真菌。同时，将毛孢子菌属、假单胞菌属、黄囊壳菌属等少见的真菌属纳入分析，旨在全面了解皮肤及皮肤结构真菌感染对AD发生发展和预后的影响作用。

Lysurus mokusin (L.f.) Fr., initially described and named ‘mo-ku-sin’ after pronunciation of Chinese ‘蘑菰蕈’ by the French missionary Cibot in 1774, is the first scientifically described fungus from China. To facilitate the correct application of its name, its typification and taxonomic study according to the current nomenclature code were carried out. The lectotype and epitype were designated, and mitochondrial genome and nuclear genome of the epitype specimen were assembled. The circulated mitochondria of L. mokusin totaled 101.1 kb, containing 26 tRNA and 16 protein-coding genes. Each nuclear haplotype contains 11 chromosomes with a total length of 33 Mb and 8/11 fragment contigs of 1.4 Mb. The BUSCO analysis suggested that the genome is 88.5% completed. This is the first genome reported for Lysurus. A high proportion of repeat sequences (ca. 16%) was detected and, after masking, 8 637 and 8 572 protein-coding genes were predicted for two haplotypes, respectively. The gene distribution shows a typical pattern of a “two-speed genome”. In addition, 27 non-redundant biosynthetic gene clusters (BGCs) were predicted, mainly distributed in Chr01, Chr04 and Chr06. Two BGCs are 100% homologous to known insecticidal and antimicrobial BGCs producing xenotetrapeptide and rhizomide. Our study provides a model for the typification of numerous early-described species lacking types in China.

菌物包括真菌界的真菌、管毛生物界中的假菌，亦即卵菌门、丝壶菌门和网菌门(并系类群)以及原生动物界中的黏菌网柄菌门、黏菌门、集胞黏菌门及其类似生物(复系类群)。真菌界的3种生存方式包括共生、噬生和腐生。

为了解暗褐脉柄牛肝菌Phlebopus portentosus种质资源群体遗传结构和遗传多样性，本研究利用rDNA ITS对9个地区的53份样品进行物种鉴定，并利用SSR分子标记对其进行遗传多样性分析。结果表明，53份样品均为暗褐脉柄牛肝菌，ITS序列相似性为92.09%；28对SSR引物共扩增出252个多态性位点，每对引物扩增位点数为48-53，多态率均高于90%，多态性位点丰富；引物Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s多样性指数分别为0.371 6-0.605 1、0.327 3-0.584 5。居群水平Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s多样性指数分别为0.097 3-0.237 0、0.142 0-0.358 6，多态率为23.48%-74.09%，居群内基因型丰富；居群间遗传分化系数和基因流均值为0.282 0、1.273 2，遗传分化程度较低，存在基因交流。UPGMA聚类遗传相似系数为0.67-0.89，相似系数在0.72水平下可将53个菌株划分为3个类群，其与PCoA主成分分析、Mantel检验和STRUCTURE聚类结果基本一致。群体结构分析可将供试样品分为8个遗传构成，且亚群2基因型最为丰富；AMOVA分析表明90%遗传变异由居群内造成。供试暗褐脉柄牛肝菌居群内基因型丰富，为中等程度遗传分化，基因交流受阻。

本研究在系统开展海南热带雨林国家公园食用菌和药用菌资源调查和物种鉴定的基础上，结合历年文献整理，列出了食用、药用真菌名录，提供了每个物种的中文名称和学名。截至2024年，海南热带雨林国家公园共发现食药用菌529种，其中包括食用菌366种、药用菌316种。发现的366种食用菌隶属于6纲15目53科122属，包括子囊菌门2纲2目4科4属7种和担子菌门的4纲13目49科118属359种。其中，红菇科(62种)和牛肝菌科(55种)种类最丰富，分别占16.94%和15.03%；红菇属、蘑菇属、乳菇属、褶孔牛肝菌菌、鹅膏菌属、侧耳属、乳牛肝菌属、木耳属、牛肝菌属和鸡油菌属为海南热带雨林国家公园食用菌的代表属。316种药用菌隶属于8纲20目69科146属，其中包括子囊菌门4纲5目11科13属20种和担子菌门4纲15目58科133属296种。其中，红菇科(33种)和多孔菌科(26种)种类最丰富，分别占10.44%和8.23%；红菇属、灵芝属、蘑菇属、侧耳属、乳菇属、硬皮马勃属、嗜蓝孢孔菌属、鹅膏菌属和栓菌属是海南热带雨林国家公园药用菌代表属。本研究揭示了海南热带雨林国家公园食用、药用真菌的多样性，为食药用菌资源的有效保护和持续利用奠定了良好的基础。

本文对粗毛纤孔菌乙酸乙酯提取物(EAE)及其主要成分(组分Fr1-Fr5和hispidin)体外抗氧化作用和保护人皮肤成纤维细胞(HSF)氧化应激损伤效果及机制进行研究。通过UPLC-MS检测、体外抗氧化实验、网络药理学等实验方法，检测EAE中多酚类化合物组成、EAE、Fr1-Fr5和hispidin还原能力和自由基清除能力、hispidin治疗氧化应激疾病潜在靶点和通路。研究表明，EAE中含有多种多酚类化合物，且hispidin是其中主要的多酚化合物；EAE、Fr1-Fr5和hispidin均有一定的还原能力和自由基清除能力，且抗氧化能力表现为EAE>Fr1-Fr5>hispidin；网络药理学分析推测hispidin治疗氧化应激疾病的核心靶点有9个，主要富集于MAPK信号通路等多条信号通路。建立HSF细胞氧化应激损伤模型，用多种方法检测细胞存活率、活性氧(ROS)水平、胶原蛋白水平及相关蛋白和相对信使RNA (mRNA)表达。结果表明，200 μg/mL的EAE、Fr4和hispidin能提高氧化应激损伤下HSF的存活率及抗氧化能力，降低丙二醛(MDA)含量和ROS水平，促进I型胶原蛋白(COLI)合成并可能通过调节MAPK通路中的MMPs/TIMPs系统抑制其降解。其中EAE对氧化损伤的HSF有显著保护作用。总之，本研究验证了粗毛纤孔菌乙酸乙酯提取物及其活性成分具有较强的抗氧化能力，且能够通过MAPK信号通路作用于多个靶点来改善由于氧化应激引起的损伤。为粗毛纤孔菌在抗氧化领域中的应用提供依据。

为深入探讨哀牢山国家自然保护区大型真菌物种及其生态多样性，研究团队于2022年8月及2024年7月在该保护区的景东片区开展了系统的野外调查和标本采集工作。采用形态学与分子生物学相结合的方法，对所采集的标本及过去20年积累的区域大型真菌标本进行全面鉴定，对物种组成、区系地理成分及新记录种进行了统计分析，并对物种资源进行了分析评价。调查结果显示，该地区共记录到312个大型真菌物种，涵盖2门、7纲、22目、66科及131属。其中，食用菌27种，药用菌13种，食药兼用菌5种，以及毒菌23种。此外，研究还发现了中国新记录种3个、云南新记录种8个以及新种1个。优势科包括红菇科Russulaceae、牛肝菌科Boletaceae、类脐菇科Omphalotaceae、丝膜菌科Cortinariaceae、蜡伞科Hygrophoraceae、鹅膏科Amanitaceae、粉褶菌科Entolomataceae、小菇科Mycenaceae和多孔菌科Polyporaceae。在属的多样性方面，优势属为红菇属Russula、丝膜菌属Cortinarius、鹅膏属Amanita、乳菇属Lactarius、小菇属Mycena、裸脚伞属Gymnopus、粉褶菌属Entoloma、马鞍菌属Helvella、湿伞属Hygrocybe、拟金钱菌属Collybiopsis、蜡蘑属Laccaria及绒盖牛肝菌属Xerocomus。从区系地理成分分析来看，该地区以世界广布成分为主(57.25%)，其次为北温带成分(29.77%)，同时还存在一定比例的泛热带成分(9.92%)和东亚成分(3.05%)。中国新记录种包括：喜马拉雅脚瓶盘菌Urnula himalayana、相似光柄菇Pluteus conformis和囊假齿菌Pseudohydnum cystidiatum，新种为哀牢囊皮伞Cystoderma ailaoshanense。ITS序列分析结果揭示该地区潜藏大量未知物种，进一步表明该地区具有较高的大型真菌物种多样性。因此，该地区大型真菌资源的相关调查亟需进一步深入开展。

盘菌是指子实体呈盘状的一类非地衣型真菌。该类真菌生境广泛、种类多样，并具有多种生态类型。广西崇左地区是桂西南喀斯特的典型代表区域，蕴藏着丰富的生物多样性资源，然而对该地区的盘菌资源多样性现状缺乏研究。本研究选取桂西南喀斯特地区的崇左白头叶猴保护区、弄岗保护区和青龙山保护区为研究区域(以下简称“区内”)，对区内盘菌资源进行调查研究，共采集盘菌标本523份，基于形态学与分子生物学方法鉴定盘菌34种，隶属于8科15属。3个保护区盘菌的香农多样性指数与辛普森多样性指数均表现为弄岗保护区>白头叶猴保护区>青龙山保护区；而白头叶猴保护区的均匀度指数为最高，Margalef丰富度指数从高到低依次为弄岗保护区>青龙山保护区>白头叶猴保护区。采用平板对峙培养法与发酵液粗提物筛选具有生防潜力菌株。结果表明，以6种病原真菌为对象，从已获得的盘菌菌株中筛选出3株拮抗菌，其中，黄小布洛克萨盘菌Bloxamia discedens菌株S0161对新暗色柱节孢菌Neoscytalidium dimidiatum的抑制作用最强，抑菌率为88.8%；而佩鲁尼软盘菌Mollisia peruni菌株QLD011和QLD012对凸出枝葡霉Cladobotryum protrusum的抑制效果明显。发酵液乙酸乙酯萃取物的抑菌特性检测结果发现，S0161抑菌效果显著，QLD012次之，而QLD011抑菌效果不明显。本研究结果丰富了我国盘菌物种资源库，并为盘菌资源开发利用以及生防菌筛选提供理论基础。

蜜环菌属作为全球广布的大型真菌类群，以其庞大的生物个体和超长生命周期著称。该属真菌在交配系统上呈现多型性特征，兼具腐生、寄生和共生等多样营养模式，其种间形态特征高度相似但遗传异质性显著，导致多种分类体系长期并存。这些独特的生物学特性不仅赋予其复杂的生态位适应能力，也使其成为真菌界兼具功能价值与研究挑战的焦点类群。密环菌属真菌突出的食药用价值及在森林生态系统中的关键作用，激发了对基础理论和应用研究的迫切需求。本文系统综述了蜜环菌属在交配系统、分类系统、生态功能领域的最新研究进展，提供了解析该属物种多样性形成机制及其生态适应性策略的理论依据；同时提出了蜜环菌属真菌的应用前景及展望。

海南省位于亚洲热带北缘，是中国唯一的热带省份；独特地理位置和气候条件孕育了丰富的生物多样性，尤其是菌物。然而，过去对于海南菌物多样性的调查和研究多聚焦于海南省中部林区，滨海环境鲜有关注。本文报道产自海岸木麻黄林中的小丽蘑属(新拟) Calocybella 1个新种和1个中国新记录种，该属首次在我国发现。海南小丽蘑Calocybella hainanensis的主要特征为菌盖姜黄色至黄褐色，菌褶淡黄色，孢子长椭圆形，较小，具弱纹饰，非淀粉质。南奔小丽蘑(新拟) Calocybella sribuabanensis的主要特征为子实体聚生，菌盖黄褐色，菌褶密，淡黄色，孢子椭圆形，具弱纹饰，非淀粉质。基于ITS序列的系统发育分析显示，海南小丽蘑在属内占据独特的进化分支，但与属内其他种类的亲缘关系尚不明确；南奔小丽蘑与产自印度的歧褶小丽蘑(新拟) Calocybella dicholamellata近缘。本研究首次报道了小丽蘑属在我国的分布，扩展了该属物种多样性及分布的认知，也提示热带滨海生境中的菌物多样性值得后续关注。

灵芝Ganodorma lingzhi的优良品种灵芝13具有农艺性状较好、子实体产量较高、孢子粉产量较高的优良性状。本研究首先以其单核菌株灵芝13-5为材料，通过三代HiFi测序及Hi-C测序组装成完整的基因组；然后选取5个重复的双核菌株通过Illumina高通量测序后，以灵芝13-5基因组作为参考进行SNP calling，建立了基于灵芝13全基因组的分子标记。基因组包含13条染色体，共45.73 Mb。5个重复菌株SNP calling去重合并后，获得319 074个共有的异核等位差异位点，作为用于灵芝13菌株鉴别的分子标记库。从实验室菌种库中随机抽取7个灵芝菌株，与灵芝13菌株共有的等位差异位点占比介于22.20%-45.18%之间，远低于阈值，说明这些菌株与灵芝13差异较大，不是相同菌株。本研究建立了基于灵芝13全基因组及其异核等位差异位点的分子标记，能够准确区分灵芝13这一优良品种。

本文采用形态学观察和ITS序列分析对采自安徽齐云山的一株野生侧耳菌株AH150进行分离鉴定，鉴定结果为巨大侧耳Pleurotus giganteus。采用单因素和正交试验筛选该菌株菌丝最适生长的碳源、氮源、温度及pH，在此基础上进行驯化栽培。结果表明：菌丝生长的最适碳源为果糖，最适氮源为蛋白胨，最适温度为30 ℃，最适pH为8，其在最适条件下表现为相对生长速率快、菌丝粗壮浓密等特征。驯化出菇试验中，出菇栽培的基质为杂木屑52%、玉米芯25%、麦麸20%、石灰2%和石膏1%，40-45 d黑暗培养菌包长满菌丝，覆土后空气湿度保持在80%以上，第11天出现原基，后加大空气湿度至85%-90%，4-5 d长出子实体。研究结果将为菌株AH150的开发利用提供重要参考。

爪哇虫草是一种具有生防潜力的昆虫病原真菌，可以防治同翅目、半翅目、鳞翅目、缨翅目、鞘翅目等多种重要害虫。对其进行液体发酵培养可获得液生分生孢子和芽生孢子，固体培养可得到气生分生孢子。本文对比了爪哇虫草IF-1106的3种孢子在形态、粒径及表面超微结构等方面的差异。结果表明，气生分生孢子、液生分生孢子和芽生孢子形态各异，平均粒径分别为4.45、4.17和7.67 μm；通过扫描电镜(SEM)观察到3种孢子一端均具有类似产痕的结构，但气生分生孢子表面粗糙，似小棒层覆盖。芽生孢子表面光滑，有明显龟裂，有些孢子有分节现象。液生分生孢子表面光滑，有少量细小裂纹，有些孢子具有类似芽痕的结构；透射电镜(TEM)显示了3种孢子细胞壁厚度和外层结构具有明显差异；碳氢吸附能力(MATH)试验表明，3种孢子的疏水性顺序为气生分生孢子>芽生孢子>液生分生孢子；此外，测定了pH在3.0-9.0时孢子表面Zeta电位变化，气生分生孢子的Zeta电位从+2.68 mV变到-18.44 mV，芽生孢子电位值变化为+5.16 mV到-5.51 mV，液生分生孢子从+0.39 mV到-18.09 mV，3种孢子等电点均在酸性范围内，在中性条件下均带负电荷；进一步对比了3种孢子的萌发速度及耐逆性，发现芽生孢子萌发最快，但耐逆性最差，气生分生孢子耐逆性强，但萌发最慢，液生分生孢子萌发速率接近于芽生孢子，且耐逆性最好，展现出良好的开发潜力。综上所述，这些结果为爪哇虫草菌在生产中的应用提供了理论基础。

大型真菌种质资源是国家种质资源库建设重要组成部分，为充分开发利用大型真菌资源，对采自百山祖国家自然保护区的一株野生真菌进行分离纯化，并将获取的纯菌株作为试验材料。通过形态学和ITS序列分析，将其鉴定为狄更斯邦氏孔菌Bondarzewia dickinsii。采用十字划线法研究固体培养条件下不同碳源、氮源、pH、温度和光照对其菌丝生长的影响，从以上4个单因素实验中选择3个最优水平进行正交试验。结果表明，狄更斯邦氏孔菌菌丝生长的最佳碳源是可溶性淀粉，氮源是酵母粉，最适pH为7.0，最适温度为25 ℃。经人工驯化栽培获得狄更斯邦氏孔菌子实体，并测定其子实体的总糖、粗蛋白质以及16种氨基酸含量；其中，总糖含量高达37.29 g/100 g，粗蛋白含量高达24.9 g/100 g。对狄更斯邦氏孔菌的人工驯化栽培，为该菌进一步的研究和开发提供参考。

树舌灵芝Ganoderma applanatum是我国重要的药用真菌之一，在我国及东亚地区均有广泛的药用历史和临床应用。长期以来以羊毛甾烷型三萜为基本骨架的四环三萜类化合物被认为是树舌灵芝真菌主要的次级代谢产物和功能成分。树舌灵芝三萜化合物种类繁多，其中7,8-环氧-9(11)-烯-12-酮-灵芝三萜是树舌灵芝区别于灵芝属其他真菌的特征性次生代谢产物之一。近年来，随着各种类型杂萜不断被发现，表明杂萜是树舌灵芝中另一大类重要的次级代谢产物。它们的结构新颖多样，主要类型为含10个碳原子长链的杂萜、含内酯基团的杂萜、含5/6/7元碳环的杂萜、含桥环的杂萜、含氮原子杂萜及二聚体杂萜。不同的结构特征决定了树舌灵芝化合物的药理活性也多种多样。这些化合物具有护肝、促进血管生成、保护神经系统、抑制脂肪细胞分化、抗炎、抑菌等药理活性。本文整理了文献报道的树舌灵芝中天然来源的98个灵芝三萜化合物和67个杂萜化合物的结构及药理活性，旨在为树舌灵芝的深入研究和开发利用提供参考。

本研究基于形态学和ITS+LSU序列分子系统发育分析，报道了海南热带雨林国家公园霸王岭片区大型担子真菌一新种—极白无锁革菌Efibula candidissima。该物种的主要特征为子实体一年生，平伏，新鲜时蜡质，雪白色，边缘具雪白色菌索，干后变为白色至乳白色，软革质至脆质；子实层体表面光滑；单系菌丝系统，无锁状联合，担孢子椭圆形至窄椭圆形，大小为4.8-5.8 × 3.3-4 μm，目前仅发现于海南，生长在阔叶树腐朽木和落枝上。

依据形态和分子系统学研究，描述了产自中国云南松上小隔孢伏革菌属3个新种，即宽丝小隔孢伏革菌Peniophorella euryhypha、松生小隔孢伏革菌Peniophorella pinicola和莲花晶小隔孢伏革菌Peniophorella stellata。这3种的共同特征为：一年生平伏担子果，白色至奶油色、光滑子实体表面，具棒状至圆柱状、无树脂覆盖薄型囊状体。P. euryhypha的主要特征为具简单分隔的菌肉菌丝(直径7.5-9.5 μm)、宽棒状至球柄状拟囊状体，窄椭圆形担孢子(9.3-11 × 3-4.3 μm)。P. pinicola的主要形态特征为菌丝具结晶、碗状冠囊体和厚壁囊状体，椭圆形担孢子(5.5-8 × 3.2-5 μm)。P. stellata的主要形态特征具莲花状结晶囊状体和椭圆形担孢子(8-10 × 3.5-5 μm)。此外，Peniophorella cremea被认为是Hyphoderma transiens的同物异名。本文还提供了中国的小隔孢伏革菌属Peniophorella物种检索表。

羊肚菌属Morchella真菌具有较高营养价值和药用价值。栽培过程中的逆境胁迫是影响羊肚菌生长发育、产量及品质的重要因素，故羊肚菌响应逆境胁迫的分子机制受到越来越多的重视与关注。以转录组学、代谢组学及蛋白质组学为基础的组学技术，已被广泛应用于羊肚菌的各项研究中，也开辟了羊肚菌逆境胁迫下分子响应机制研究的新视角。本文综述了近年来组学技术在羊肚菌响应非生物胁迫(温度、干旱、矿物质、光照等)和生物胁迫方面的研究进展，并对未来发展进行了展望，以期为羊肚菌抗逆响应机制的研究提供参考依据。

以棕榈酸刺激人结肠癌上皮细胞Caco-2构建高脂膳食模式下的紧密连接蛋白损伤模型，研究银耳多糖对肠道屏障的影响及作用机制。通过检测细胞活力、细胞完整性、氧化还原水平、炎症因子含量、紧密连接基因和蛋白表达量，以及炎症信号通路表达水平，发现400 μg/mL TPs银耳多糖对Caco-2细胞无毒性，能够提升细胞SOD和CAT含量并降低MDA含量，抑制促炎因子IL-1β、TNF-α、IL-6释放，提升紧密连接蛋白Claudin-1、Occludin和ZO-1的mRNA和蛋白表达水平，通过抑制TRL4/MyD88/NF-κB炎症信号通路下调促炎因子分泌。银耳多糖通过抗氧化、抑制炎症因子分泌、提升紧密连接蛋白表达参与维护肠道屏障。

以中华包革耳(俗称金耳菌)单孢菌株NX-20基因组为参考基因组，以4个不同交配型单孢菌株D13、D25、D40和D47基因组重测序数据为研究对象，利用生物信息学软件鉴定出大量的SNP和InDel变异位点并分析其特征。使用primer5.0软件设计SNP/InDel标记引物，筛选存在多态性差异的8对SNP和6对InDel标记引物对我国金耳栽培产业中广泛使用的14个中华包革耳菌株进行遗传多样性分析。SNP标记分析结果显示，J2F1菌株在8对SNP引物中均形成2种基因型，其他菌株仅有一种基因型。6对InDel标记引物分析结果显示，J2F1菌株在第1、2及第5对引物中能扩增出不同于其他菌株的条带，大部分菌株能扩增出一致的条带(如YL、YR、JB、LL及SC等菌株)，显示出同种异名现象。本研究结果对我国中华包革耳栽培种质资源的遗传多样性有了比较明确的认识，所获得的SNP和InDel标记可进一步用于中华包革耳遗传分析，为中华包革耳遗传多样性、种质资源鉴定和保护及分子辅助育种等研究助力。

通过考察雷丸老伞Gerronema lapidescens (中药名：雷丸)子实体在不同栽培基质、光照强度及栽种季节下的生长情况，探究个体发育特征及驯化栽培的最适条件。观察表明，子实体形成过程中，雷丸老伞菌丝先交织为米粒状原基，经伸长、增粗后形成白色柱状子实体；随后柱状体顶端中央部分膨大分化为半球形黑色菌盖，随着菌盖颜色由深变浅，体积逐渐增大，产生担孢子，形成成熟子实体。菌核形成的过程中，菌丝先聚集成束形成菌索，菌索末端萌发出结构较为疏松的白色菌丝团，随着菌丝团密度的增加、体积的扩张以及表皮颜色的由浅入深，菌丝团逐渐形成成熟的菌核，并从菌索上脱落。栽培条件研究表明：在配方为木屑87.7%、玉米粉5.0%、麦麸5.0%、豆粕1.0%、石膏1.0%、MgSO₄ 0.1%、KH₂PO₄ 0.2%的栽培基质中，菌丝日生长量最快，长势旺盛，为最佳栽培配方。环境温度较高的8月份是人工诱导子实体萌发的最适时间。在700 lx光照强度下，子实体形态最接近于野生状态。

丝膜菌属Cortinarius是蘑菇目中最大的一个属，与多种植物存在共生关系，对生态平衡稳定具有重要作用。特拉蒙亚属Telamonia是丝膜菌属中物种数量最多的亚属，该亚属真菌在湿润条件下菌盖表面无黏性。本研究基于形态描述与分子系统发育分析方法，对中国丝膜菌属特拉蒙亚属的馆藏标本开展分类学研究，共发现106个物种，其中中国新记录种11个。本研究整理了各物种相关信息，对中国新记录种进行了详细描述。

竹类植物是我国重要的森林资源，具有很高的经济与生态价值。丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi, AMF)在其生长发育的各个环节均发挥了重要作用，但目前围绕竹类植物根系AMF群落的研究十分匮乏。本研究在竹类种质资源保存库内开展，以毛竹Phyllostachys edulis、淡竹Ph. glauca等8个属24种我国常见竹子为研究对象，利用Illumina MiSeq平台高通量测序的方法，探究了宿主竹种和土壤化学性质对于根系AMF群落多样性与组成差异的影响方式和特点，分析了不同竹种根系AMF群落组成相异性与竹类植物遗传距离的关系，并通过网络分析探究了竹类植物-AMF二分网络结构特性。24个竹类植物根系AMF群落中共检测到1 805 725条序列，得到473个扩增子序列变体(amplicon sequence variant, ASV)，可归为9个属。其中，球囊霉属Glomus为优势属，盾巨孢囊霉属Scutellospora、无梗囊霉属Acaulospora和巨孢囊霉属Gigaspora为最常见属或常见属。本研究区内，宿主竹种类型对竹类植物根系AMF的ASV香农-威纳指数、ASV丰富度等多样性指数及群落组成差异具有显著的单独作用，可解释多样性指数总变差的22.28%，ASV水平群落组成总变差的20.06%，属水平群落组成总变差的27.40%。pH等6个土壤因子对于保存区内竹类植物根系AMF群落多样性和组成的差异无显著效应。不同竹种间遗传距离与其根系AMF群落组成的Hellinger距离均值呈显著正相关，表明亲缘关系越近的竹种具有更为相似的根系AMF群落。竹类植物-AMF互作网络结构特性指标普遍显著高于或低于假定物种随机互作的零模型预测值，该二分互作网络结构具有低嵌套性(25.07)、低连接度(0.17)、中低水平特异性(0.35)和中低水平模块性(0.36)的特征，表明竹类植物AMF之间对于资源的竞争强度较高，互作网络的稳定性较低。本研究对深入了解竹类植物与AMF互作关系提供了参考依据。

为探究虫草素对长期使用他克莫司导致的糖代谢紊乱和肾损伤的改善作用，将32只小鼠随机分为对照组(CON)、他克莫司模型组(TAC)、虫草素低剂量治疗组(TAC_CORL)和虫草素高剂量治疗组(TAC_CORH)，每组8只，连续给药8周。测定空腹血糖(FBG)、腹腔内葡萄糖耐量曲线下面积(AUC)、血肌酐(Scr)、血尿素氮(BUN)、血清白介素-1β (IL-1β)和血清白介素-6 (IL-6)，HE染色检测小鼠胰腺和肾脏病理损伤情况；采用16S rRNA 基因测序检测小鼠粪便肠道菌群。与TAC组比较，虫草素能够明显降低FBG、AUC、Scr、BUN水平；HE染色结果表明虫草素能够明显改善胰岛β细胞致密核心分泌颗粒的扩张和空泡化以及肾小球空泡化、肾小管上皮细胞发生的水肿变性和脱屑；同时，虫草素还能够影响门水平和属水平肠道菌群种类和相对丰度的变化。此外，FBG、AUC、Scr和BUN等环境因子与一些肠道菌属呈正相关或负相关。提示虫草素可能通过调节肠道菌群改善小鼠长期给予他克莫司引起的糖代谢紊乱和肾损伤。

本文通过形态学、解剖学、化学以及基于内转录间隔区(ITS)、核糖体大亚基(nuLSU)、线粒体小亚基(mtSSU)序列联合的系统发育学分析研究方法，确定鳞粉衣属Phyllobaeis一新种，即亚壳鳞粉衣P. subcrustacea。该种特征是地衣体壳状，有疣状突起；子囊盘浅红棕色至深棕色，圆饼状，盘面平坦或凹陷，盘缘明显；果柄不明显；侧丝单一或二叉分支；子囊长棒状，含8孢子，子囊顶器I-；子囊孢子卵圆形至纺锤形，无色，无隔或具1隔，I-。该种模式产自中国浙江。本文对该新种进行了表型描述并提供了特征照片，同时提供了鳞粉衣属已知物种检索表，为该属的生物多样性研究提供了基础资料。

粉孢革菌属物种是一类常见于倒木上，引起木材褐色腐朽的革状真菌。基于分子和形态证据，本研究描述了2个采自海南的新种——粒状粉孢革菌和海南粉孢革菌。粒状粉孢革菌的主要区别特征是：子实体革质，表面具轻微小颗粒状，呈浅橘色至灰橘色，担孢子较大，椭圆形，大小为12.5-14.2 × 8.2-9.5 μm。海南粉孢革菌的主要特征是：子实体膜质，表面光滑，灰橘色至褐橘色，边缘毛缘状，担孢子长椭圆形，大小为9.8-12.2 × 5.2-6.5 μm。本文对两新种进行了详细描述并提供了子实体和显微结构图片。

为提高六妹羊肚菌边角料中麦角硫因的得率，以麦角硫因得率为评价标准，分析了提取温度、乙醇浓度、液料比、提取时间等单因素对麦角硫因提取量的影响，在单因素实验的基础上通过响应面法对六妹羊肚菌边角料中麦角硫因的提取工艺条件进行了优化。单因素和响应面法得到的麦角硫因最佳提取工艺条件：液料比为40:1 (体积质量比)、乙醇浓度为50%、提取温度为60 ℃、提取时间为20 min。以该条件进行验证实验所得麦角硫因提取量为(0.236±0.000 887) mg/g，与预测值0.235 mg/g无显著差异(误差值0.426%)，表明优化得到的工艺具有有效性和可靠性。本研究确定了六妹羊肚菌边角料中麦角硫因的最佳提取工艺，为六妹羊肚菌边角料的开发利用提供基础数据。

三维表型结构信息在灵芝生长过程监测和精准育种中发挥着重要作用。为快速、无损、精准地获取灵芝表型信息，本研究提出了一种基于多视角图像三维重构的灵芝子实体三维表型参数提取方法。使用智能手机获取待测子实体的网格模型；将网格模型转化为点云模型，对其进行尺寸校正；沿Z轴进行点云切片，根据切片位置提取子实体点云，使用基于颜色的区域分割算法提取粗糙孔口表面部件；使用DBSCAN (density-based spatial clustering of applications with noise)算法和最近邻分配算法分割精细菌盖、孔口表面和菌柄部件；最后从不同部件中提取菌盖厚度、菌盖横轴、菌柄长度、子实体体积、菌盖颜色、孔口表面颜色、菌盖投影面积等表型参数。结果表明，与真实值相比，使用本研究方法计算的菌盖厚度、菌盖横轴、菌柄长度和子实体体积的均方根误差(root mean squared error, RMSE)分别为1.10 mm、4.55 mm、1.53 mm和0.038 L，决定系数(R²)分别为0.995、0.972、0.986和0.981。所提方法可以精准提取灵芝子实体三维表型结构信息，并有望拓展应用至其他食药用菌子实体。

江西省乐安县牛田镇古樟林素有“中国第一古樟林”之美称，拥有3 000余棵100-1 200年的古樟树，现已被列为国家生态公益林加以保护。为探明该古樟林不同树龄香樟菌根类型及AM真菌种类多样性，本研究采用根系组织染色、根际土壤AM真菌孢子过筛分离，以及显微形态观察的方法进行了研究和分析。结果表明，香樟菌根以产生丛枝和泡囊结构的AM为主要类型，并观察到少量产生深色有隔菌丝和微菌核结构的DSE共生类型；从采自100、200、400、600、800及1 200年树龄的古香樟树根际土壤样品中分离和鉴定出5科8属15种AM真菌，其中以黄孢球囊霉Glomus flavisporum和黑孢球囊霉G. melanosporum分布最广；从古香樟根系AM真菌定殖频率和根际土壤AM真菌孢子数量来看，呈现随树龄增加而下降的趋势。研究结果表明，江西省乐安古樟林拥有丰富的AM真菌种类多样性，其在1 000余年树龄香樟的根系和根际土壤中不断生长和繁殖，为保持古香樟树的健康生长发挥了重要生态学功能。本研究为加强乐安古樟林生态保护和AM菌根菌资源利用提供了理论依据。

杜英Elaeocarpus decipiens Hemsl是我国南方重要的经济及药用树种。间座壳目Diaporthales真菌种类多样，常作为病原菌或内生真菌存在，但与杜英相关真菌多样性研究尚不完善。本研究从海南省琼州市采集的杜英叶片上分离获得4株间座壳目真菌，结合形态学特征及基于ITS、LSU、TEF1-α、TUB、RPB2位点的分子系统发育分析，鉴定出Melanconiella qiongzhouensis和Lasmenia hainanensis 2个新种。首次报道了杜英上间座壳目真菌物种多样性，进一步扩展了与杜英相关真菌的特征和分布。

古侧柏Platycladus orientalis具有独特的历史、文化及景观生态价值。链格孢属Alternaria真菌物种丰富且分布广泛，是引起侧柏叶枯病的重要病原菌之一。本研究从北京古侧柏叶枯病标本中分离出大量链格孢属菌株，根据PCA培养基上菌丝产孢结构及分生孢子的形态特征，并结合ITS、GAPDH、TEF1、RPB2和ALT这5个基因位点的系统发育分析，将这些菌株鉴定为链格孢Alternaria alternata、A. subcucurbitae、A. cantlous及新种侧柏链格孢A. platycladi，其中A. subcucurbitae和A. cantlous首次在侧柏上报道。科赫氏法则检验证实这4种链格孢菌均可引起侧柏叶枯病。

谷氨酰胺合成酶是氮素同化的关键酶，在生物体氮代谢过程中发挥重要作用。本文从糙皮侧耳中克隆获得了一个GlnA家族的谷氨酰胺合成酶基因PoGlnA，首先，对PoGlnA蛋白进行了异源表达、纯化和酶活性测定，结果表明：PoGlnA基因的编码区长1 446 bp，编码481个aa；PoGlnA蛋白的分子量为53 kDa，具有谷氨酰胺合成酶活性。然后，将PoGlnA蛋白与其他已报道的谷氨酰胺合成酶蛋白进行了系统发育关系分析，结果显示：PoGlnA蛋白与细菌来源的GlnA蛋白具有相对更近的亲缘关系，与已报道的食用菌来源的谷氨酰胺合成酶亲缘关系较远。最后，从转录水平和翻译水平分析了PoGlnA基因对氮饥饿和不同种类氮源的响应，结果显示：氮饥饿、天冬氨酸、天冬酰胺、亮氨酸和谷氨酸处理可促进PoGlnA基因表达，铵态氮和谷氨酰胺处理对其表达无影响，但硝态氮处理抑制其表达。此外，本文还通过抗原表位分析获取了PoGlnA蛋白的优势抗原肽段，并制备了特异性的PoGlnA多克隆抗体，为深入揭示PoGlnA基因的生物学功能奠定了基础。

水通道蛋白(AQP)基因家族在真菌的水分运输及多种生理过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法系统鉴定糙皮侧耳Pleurotus ostreatus AQP家族成员(PoAQPs)，并对其理化性质、亚细胞定位、染色体定位、系统进化关系、保守基序以及启动子顺式作用元件进行分析。同时，通过RT-qPCR检测PoAQPs基因在不同生长阶段以及水分过剩胁迫条件下的相对表达量。分析显示，糙皮侧耳基因组中共鉴定出5个PoAQPs成员，分为经典AQP和AQGP 2个亚家族，均含有MIP超家族结构域和经典的水通道蛋白三级结构特征；5个PoAQPs基因分布于4条染色体上，亚细胞定位预测结果显示，这些基因均定位于细胞膜；同一亚家族的成员具有相似的保守基序；启动子区域富含大量的激素响应和非生物胁迫相关的调控作用元件；RT-qPCR结果显示，PoAQPs基因在不同生长阶段和水分过剩胁迫条件下的表达存在显著差异，且主要在糙皮侧耳的子实体阶段以及水分过剩胁迫8 h中高表达。推测PoAQPs在调控糙皮侧耳的生长发育及非生物胁迫响应中发挥作用，这一发现为深入理解糙皮侧耳的水分调控机制及抗胁迫品种的培育提供了理论支持。

菌塘是菌根食用菌形成子实体的重要场所，菌塘中存在可以促进菌根形成的微生物，因此对菌塘土壤微生物群落的系统研究和深入分析对于了解食用菌菌根形成至关重要。为明确血红色钉菇菌塘土壤中微生物群落组成和多样性，本研究对血红色钉菇菌塘与非菌塘土壤样品进行扩增子测序，结果显示非菌塘土壤细菌和真菌的Chao 1、Observed species、Shannon、Simpson、Pielou指数显著大于菌塘土壤(P<0.05)；菌塘与非菌塘土壤细菌优势门均为变形菌门Proteobacteria，在菌塘土中，变形菌门的相对丰度大于其在非菌塘土中的相对丰度；菌塘与非菌塘土壤优势真菌门为担子菌门Basidiomycota，在菌塘土中，子囊菌门Ascomycota的相对丰度高于非菌塘土；罗兹菌门Rozellomycota的相对丰度是非菌塘土相对丰度的2.94倍；菌塘与非菌塘土壤真菌优势属为红菇属Russula和乳牛肝菌属Suillus，在菌塘中，Leptodontidium属的相对丰度为非菌塘中的1.27倍，青霉属Penicillium的相对丰度为非菌塘中相对丰度的4.47倍，乳牛肝菌属的相对丰度为非菌塘相对丰度的5.72倍，树粉孢属Oidiodendron相对丰度为非菌塘中相对丰度的6.31倍，篮状菌属Talaromyces的相对丰度为非菌塘中相对丰度的18.14倍，其中色钉菇属Chroogomphus和蜡壳耳属Sebacina只存在于菌塘土壤中。LEfSe分析揭示相对于非菌塘土壤，菌塘土壤中共获得26个不同分类水平（1个门、1个纲、4个目、6个科、9个属、5个种）的真菌和20个不同分类水平（2个门、3个纲、3个目、6个科、6个属）的细菌指示类群。共线性网络分析表明菌塘和非菌塘土壤真菌和细菌群落的节点数和边数差异不显著，菌塘土壤中血红色钉菇与细菌ASV20 (变形菌门未培养菌)和真菌ASV22 (绒毛菌属Tomentella)的丰度呈正相关，且相关性较高。研究结果将为血红色钉菇的人工驯化栽培提供理论基础。

本研究通过形态学和分子系统学相结合的方法对采自海南热带雨林国家公园的大型真菌标本进行鉴定，发现了环纹炭团菌属的3个中国新记录种，分别是：努里格环纹炭团菌Annulohypoxylon nouraguense，近亮环纹炭团菌A. subnitens和绿层环纹炭团菌A. viridistratum。根据所获得的标本对这3个种进行了详细的宏微观形态描述与图示，且与其相近种进行特征讨论。基于ITS序列采用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树，3个新记录种均得到分子数据支持。

根据形态学、解剖学和化学特征的综合数据，结合核糖体内转录间隔区(ITS)、线粒体小亚基(mtSSU)和核糖体大亚基(nrLSU)的三位点序列推断的系统发育分析，报道微孢衣属Acarospora中的2个壳状地衣新种。铜色微孢衣Acarospora aenea的主要特征是上表面铁锈色，子囊盘埋生，盘面黑色、被粉霜，上皮层较厚及子囊孢子较大(4-6.5 × 2.5-3.5 µm)；吐鲁番微孢衣Acarospora turpanensis的特征是上表面红棕色至白棕色、具粉霜，藻层不均匀，子囊孢子狭椭圆形、周缘有包膜。对ITS序列数据进行的“自动分区组合物种”(ASAP)分析也支持对新物种的识别。

木腐真菌作为森林生态系统中的分解者发挥着关键作用。本研究基于形态学和分子系统学证据描述并绘制了来自中国云南省的2个木腐真菌新种：小孢脊革菌Lopharia minispora和斑点脊革菌Lopharia punctata。L. minispora的形态特征为革质担子果，具浅棕色有裂纹的子实层体，菌丝系统一体系具锁状联合，担孢子窄椭圆形，大小为5.5-6.7 × 2.7-3.3 µm；L. punctata的形态特征为膜质担子果，具白色至奶油色的子实层体，菌丝系统一体系且生殖菌丝具简单分隔，担孢子近球形至球形，大小为9.5-12 × 7.5-10.1 µm。研究采用最大似然法、最大简约法和贝叶斯推断法对研究标本的ITS+nLSU rDNA基因序列进行系统发育分析，分析表明2个新物种隶属于Lopharia，其中L. minispora与Lopharia erubescens聚为姐妹种，L. punctata与Lopharia ayresii和Lopharia resupinata支系为近缘类群。

松脂皱皮孔菌Ischnoderma resinosum是一种药食兼用真菌，具有开发成为保健品的潜力。为了便于今后对此真菌的保护利用，对1株采自吉林省长白山的松脂皱皮孔菌进行生物学特性和抗氧化活性的研究。在固体培养基上，采取单因素试验、正交试验及Box-Behnken设计对其菌丝在不同碳源、氮源、无机盐、pH和温度的长势进行研究，明确最适生长条件；通过液体发酵培养，采取分光光度法针对抗氧化活性的多个指标进行了测定。结果显示通过5个因子的单因素试验，明确了松脂皱皮孔菌的最适生长条件：以蔗糖为碳源、麦芽浸粉为氮源、KH₂PO₄为无机盐、pH 6.0、温度25 ℃；经正交试验得出对松脂皱皮孔菌菌丝生长速度的影响依次为：氮源>碳源>pH>无机盐；Box-Behnken设计成功确定了影响松脂皱皮孔菌菌丝生长速度关键因子的水平；通过液体培养发现，松脂皱皮孔菌能够大量分泌多糖、多酚和抗坏血酸，并表现出超氧化物歧化酶活性和清除羟自由基的能力。本研究表明适宜松脂皱皮孔菌菌丝生长的最适培养条件为蔗糖20.0 g/L、麦芽浸粉13.0 g/L、KH₂PO₄ 0.7 g/L、pH 5.0、温度25 ℃，菌丝生长速度达到(12.07±0.11) mm/d；通过对液体培养过程中各指标的测定，证实了松脂皱皮孔菌具有抗氧化活性。

灵芝的民间药用历史悠久，具有重要的药用价值和经济价值。为充分保护和开发海南热带雨林野生灵芝资源，对采自海南热带雨林国家公园五指山片区的1株野生灵芝菌株X2287进行分离鉴定。利用形态学和TEF1-α-RPB2序列相结合的方法鉴定该菌株为无柄紫灵芝Ganoderma orbiforme。本文对其菌丝的生物学特性及驯化栽培条件进行初步研究。结果表明，菌丝生长最适碳源为蔗糖、最适氮源为氯化铵、最适pH为5.0、最适温度为30 ℃。在驯化栽培过程中，发菌温度25 ℃、黑暗条件下菌丝约30 d满袋；原基形成约7-10 d，出原基后约25 d子实体成熟。研究结果可为海南热带雨林特色灵芝资源发掘、新品种选育提供基础数据参考。