基于形态学、化学特征及分子系统发育学证据，本研究报道了2个中国地衣新记录属：金氏衣属Gintarasia和星缘衣属Asteristion，其中包括1个新种——假裂金氏衣G. pseudochapsa和 1个新记录种——杯星缘衣A. cupulare，标本采自中国海南省。基于ITS、nuLSU及mtSSU序列构建联合数据集，采用最大似然法与贝叶斯推断进行系统发育分析；地衣特征化合物采用薄层色谱法检测。假裂金氏衣的主要特征为：地衣体灰绿色；子囊盘为不规则圆形至不规则线形，盘面肉色、无粉霜；子囊孢子非淀粉质；地衣体未检出地衣特征化合物。杯星缘衣的特征为：地衣体黄绿色；子囊果聚生，盘面肉色并具白色粉霜，具双层盘缘；果壳未炭化。本文提供了相关分类单元的详细形态描述、图版，并与近缘种进行了比较和讨论。
湿伞属是具有重要生态意义且十分引人注目的大型真菌类群。然而，该属食用菌的正式记载较为稀少。本文调查研究了江西上饶地区元宵节前后发生的一种野生食用菌，俗称“元宵菇”“竹菇”或“红菇”，其鲜品价格高达1 000元/kg。经形态学和分子系统学研究证明该物种为一个湿伞属新物种，命名为元宵湿伞Hygrocybe yuanxiaogu。该真菌的主要特征为菌盖红色至黄色、不黏或湿时微黏，担孢子(7.0)7.5-9.5 × 4.0-5.5 μm；子实体常生长于竹林中，在当地仅元宵节前后出现。基于ITS序列的系统发育分析显示，该种隶属湿伞属的红湿伞复合群Hygrocybe punicea-complex，与已知物种存在明显区别。新种的发现丰富了中国南方湿伞属已知物种的多样性，也为该属的可食用野生菌资源提供了新实例。
为揭示井冈山国家级自然保护区大型木生真菌的物种多样性现状，本研究综合运用形态学观察与分子生物学鉴定方法，对保护区内采集的2 377份木生真菌标本进行了系统性研究。共鉴定出木生真菌243种，隶属于2门7纲13目45科139属。其中，多孔菌科和锈革孔菌科为优势科，占总种数的33.33%；栓孔菌属等8个属为优势属，共包含51种，占总种数的20.99%。在区系组成上，以世界广布属(56.83%)和热带-亚热带分布属(10.07%)为主，体现了中亚热带森林的典型特征。此外，研究还发现50种具有重要经济价值，其中包括食用菌6种、药用菌37种、食药用菌7种。研究结果为区域真菌资源保护、开发及多样性研究提供了科学依据。
兰科独蒜兰作为我国传统名贵药用植物，自然条件下，需与真菌共生才能完成其生活史，因此共生真菌的分离、鉴定对于今后应用共生技术解决其资源再生问题至关重要。本文以云南昭通地区野生、仿野生和基地栽培的独蒜兰Pleione bulbocodioides为研究对象，比较分析了不同生长条件下独蒜兰根内可培养内生真菌群落组成及多样性。采用组织分离、单菌丝团和稀释研磨3种分离方法，共获得619株真菌，经形态和核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacer, IFS)序列分析，鉴定隶属于4门9纲20目30科40属，整体分离率为6.76%。不同生长条件下的独蒜兰根内生真菌群落结构差异显著，其中，林下仿野生样品真菌多样性最高(Hʹ=2.726，D=0.905 5)、群落结构最均衡(J=0.827 1)，优势属为Irpex (IF=21.23%)；基地栽培样品优势菌种集中，主要为Dactylonectria (IF=54.18%)；野生的样品中获得的可培养真菌资源最少，仅分离得到4个属，优势属为Neopyrenochaeta (IF=60.00%)。结果表明林下仿野生栽培模式下独蒜兰具有更稳定、多样的根内共生微生物体系。该工作为独蒜兰有益共生菌筛选及人工栽培模式优化提供科学依据。
糖尿病足真菌感染因皮肤屏障受损及微循环障碍诱发，在致残中的作用长期被忽视。本研究系统分析36例确诊病例，利用多维可视化模型剖析病原学与预后的关联。致病菌谱涉及念珠菌属、曲霉属、镰孢属、毛霉目、丝孢酵母属、马杜拉菌属、红酵母属等。聚类及主成分分析识别出两类表型簇：由镰孢属和毛霉目构成的“高侵袭性-血管破坏型”，与高Wagner分级及截肢显著正相关；念珠菌属为主的“生物膜-慢性定植型”，易形成耐药生物膜导致创面迁延。风险量化模型表明，Wagner分级≥3级是首要独立危险因素，存在明显阈值效应。此外，主成分分析结果显示，部分具有特殊药敏特征的念珠菌呈现出向高危组偏移的趋势，提示其临床转归可能受多种因素影响，而非单纯由耐药性决定。基于此，本研究提出了一套标准化的诊疗流程，强调“培养+病理+分子”多模态诊断，并建议对于≥3级或高危菌种患者，早期启动广谱强效抗真菌治疗并配合彻底清创，旨在通过早期干预降低截肢风险，提高患者预后。
本研究构建基于Deeplabv3+算法的人工智能(AI)模型，旨在实现临床常见皮肤癣菌菌种的快速精准分类，提升传统诊断效率。选取74株临床常见皮肤癣菌(包括红色毛癣菌、须癣毛癣菌、犬小孢子菌、絮状表皮癣菌)，经内转录间隔区(ITS)测序验证菌种准确性后，培养并采集乳酸酚棉兰染色图像962张，按3:1比例分配为训练集(839张)与测试集(123张)，用于模型构建与性能验证，并与临床技师人眼识别结果进行对比。AI模型对4种皮肤癣菌的总体准确率为71.54%，各类别召回率分别为犬小孢子菌80.00%、絮状表皮癣菌79.07%、须癣毛癣菌65.00%、红色毛癣菌53.33%；临床技师人眼识别的总体准确率为72.36%，AI识别和人眼识别结果一致性检验提示两种方法一致性程度较强(Kappa=0.769，P<0.01)；亚组分析显示红色毛癣菌、须癣毛癣菌 Kappa值分别为0.875和0.808，提示一致性极强，而絮状表皮癣菌和犬小孢子菌 Kappa值分别为0.677和0.534。两组总体准确率差异无统计学意义(χ2=0.33，P>0.05)，但AI模型对须癣毛癣菌的识别召回率显著高于人眼(P<0.05)，对絮状表皮癣菌的识别召回率显著低于人眼(P<0.05)。在识别速度方面，AI平均识别速度为(2.46±0.04) s/张，显著快于人眼的(3.75±0.61) s/张(P<0.05)，且可批量连续处理图像(962张总耗时约40 min)，无性能衰减，而人眼受视觉疲劳限制需间断休息，处理同等图像总耗时约290 min。本研究首次构建皮肤癣菌AI分类模型，填补了该领域研究空白，其识别准确率与临床技师相当且一致性较强，同时具备更快识别速度、稳定批量处理能力及不受时空限制的优势，可为基层医院及临床快速诊疗提供新工具，具有良好推广应用前景。
磷(P)是植物生长发育的必需元素，但土壤中绝大部分磷以难溶性形态存在，植物难以直接利用。溶磷微生物通过分泌有机酸和铁载体等有效活化土壤难溶磷，促进植物的磷素吸收与生长。基于高效溶磷与高产铁载体能力，结合系统发育分析和生理性状评价，本研究从典型磷限制生境中筛选获得优良菌株，评估其解钾能力与生防潜力。从山东东营盐碱地和江西上饶杉木林酸性土壤中共分离获得11株兼具高效溶磷与高产铁载体能力的真菌，经综合遴选，其中7株为优良菌株；对磷酸钙、磷酸铁和磷酸铝溶解能力最强的菌株分别为H2、R13和R33；7个优良菌株在3 d内铁载体产量均达饱和水平的90%以上，且产量与培养基pH值呈显著负相关。相关性分析表明，磷酸钙溶解能力与苹果酸、富马酸含量和铁载体产量正相关，磷酸铁溶解能力与草酸、乙酸、柠檬酸、富马酸、丁二酸含量和铁载体产量正相关，磷酸铝溶解能力仅与酒石酸含量正相关；铁载体产量与柠檬酸、富马酸含量呈极显著正相关，提示其与特定有机酸存在协同调控机制。在解钾培养基中7个菌株均能生长，但添加氯化铁后生长受到完全抑制，说明菌株解钾能力与铁载体机制相关。7个菌株的发酵滤液对禾谷镰孢菌Fusarium graminearum的抑制率与铁载体产量呈显著正相关，菌株S4在铁载体含量为53.16%时抑菌率达87.95%。基于RPB2与ITS基因的多基因系统发育分析及扫描电镜形态观察，将菌株H5鉴定为阿达青霉Penicillium adametzii；R6、R18、H2、H1和R13均鉴定为青霉属Penicillium sp.，与草酸青霉P. oxalicum亲缘关系较近；S4鉴定为曲霉属Aspergillus sp.，与塔宾曲霉A. tubingensis亲缘关系较近。综上所述，本文筛选出的7个真菌优良菌株在活化不同形态难溶磷、解钾及抑制病原真菌等方面均表现出较高的水平，可为开发新型微生物肥料与农药提供菌种资源和理论依据。
细极链格孢Alternaria tenuissima侵染引起的五味子叶枯病，是五味子生产中的重要病害。为解析病菌的侵染过程，通过同源重组技术构建了GFP荧光标记载体pBS-HYG-GFP，并优化了原生质体制备条件(菌龄36 h，采用0.01 g/mL崩溃酶 + 0.01 g/mL溶壁酶 + 0.01 g/mL蜗牛酶，28 ℃酶解2.5 h)，使原生质体产量达1.14×106个/mL。遗传转化后获得生长速率、产孢能力和致病力与野生型无差异的稳定荧光菌株SccA071GFP。侵染过程观察发现，接种36 h后，分生孢子在叶表附着萌发后芽管发育为初生菌丝，菌丝优先沿叶表凹陷处延伸，主要通过气孔或细胞间隙侵入叶片组织；接种96 h后，菌丝在叶肉组织内网络状扩展；120 h时，菌丝大量分枝密布组织，完成了侵入、潜育和显症全过程。本研究首次构建了高效稳定的细极链格孢遗传转化体系，揭示了病菌经气孔侵入、在寄主组织快速定殖的完整侵染过程。研究结果不仅为病原菌功能基因鉴定提供了稳定高效的遗传转化体系，也为病菌侵染和致病机制的深入研究提供了理论基础。
牛肝菌目真菌多数为外生菌根共生种类，中华腐生牛肝菌Buchwaldoboletus xylophilus作为该目腐生型一珍稀物种，是全球第二种人工栽培的牛肝菌，在科研与产业上均具有重要价值，然而其基因组信息尚属空白。本研究利用PacBio测序技术结合Hi-C辅助组装，首次构建了中华腐生牛肝菌染色体级别的高质量基因组。该基因组包含12条染色体，总长度为30.13 Mb，GC含量为50.38%，重叠群N50达2.64 Mb，BUSCO完整度为98.5%；共注释到11 195个蛋白质编码基因。比较基因组学分析表明，中华腐生牛肝菌转座子含量(9.97%)显著低于共生型牛肝菌(如美味牛肝菌的TEs占比约39.5%)，提示其基因组在腐生策略下更为稳定。基因家族演化呈现“收缩-扩张”协同模式：收缩主要集中在细胞壁修饰、转录调控等互作相关功能；扩张则涉及环境感知、木质纤维素降解[如2OG-Fe(Ⅱ)氧化酶]及DNA修复等，适应于腐木分解生态位。CAZymes分析显示，该菌富含糖苷水解酶(GHs，42.33%)和辅助活性酶(AAs，14.88%)，具备高效降解植物细胞壁的能力；其次级代谢基因簇较少(25个)，反映其能量分配倾向于碳源获取。系统发育分析确认其隶属于牛肝菌科辣牛肝菌亚科，分化于13.84-33.82百万年前。共线性比较揭示，牛肝菌目核心基因组虽保守，但约39%的基因存在非共线性分布及染色体重排，这些结构变异可能与不同营养方式的适应性分化相关。本研究首次系统解析了中华腐生牛肝菌基因组的适应性分子特征，为揭示真菌生态适应性进化机制，以及推动该物种的遗传育种与生物降解应用提供了理论基础与基因组资源。
农杆菌介导转化法(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation, ATMT)是丝状真菌遗传改造与基因功能研究的核心技术之一。该方法利用根癌农杆菌天然的Ti质粒加工与转移系统，通过T-DNA剪切与整合机制，将外源目的基因高效地插入丝状真菌基因组中。作为虎杖象甲长期培植的专性共生真菌，梅花状青霉Penicillium herquei在宿主营养供给、生态适应及代谢调控等过程中发挥重要作用，但由于缺乏高效稳定的遗传操作工具，其分子机制研究仍相对滞后。本研究以虎杖象甲培植真菌梅花状青霉Penicillium herquei Ph506为对象，构建了一套高效稳定的遗传转化体系。首先，通过抗生素敏感性实验确定了筛选标记，采用75-100 μg/mL潮霉素B或100-150 μg/mL遗传霉素，并联合200-300 μg/mL噻孢霉素用以筛选转化子。其次，将携带mCherry红色荧光蛋白基因及相应抗性基因的穿梭质粒分别导入根癌农杆菌AGL-1感受态细胞中。在转化操作中，以研磨后的幼嫩菌丝悬液为受体，将农杆菌与菌丝悬液共培养于IM固体培养基上以诱导T-DNA转移。共培养7 d后，经含相应抗生素的PDA培养基覆盖筛选，获得抗性转化子。通过基因组PCR验证目的基因已整合至基因组中，荧光显微镜观察证实转化子菌丝内可稳定表达mCherry红色荧光蛋白。为进一步提升转化效率，采用单因素变量法对核心参数进行了系统优化，确定诱导剂乙酰丁香酮(AS)最适浓度为200 μmol/L，农杆菌菌液最适浓度OD600为0.6，共培养最适温度为25-28 ℃。在优化条件下，转化子数量显著提升。这一高效ATMT体系的建立，不仅填补了共生真菌Ph506遗传操作工具的空白，也为后续深入开展该菌株的基因功能鉴定及代谢产物合成调控奠定了坚实的技术基础。
裂殖酵母的自主复制序列结合蛋白2 (autonomously replicating sequence-binding protein 2, Abp2)参与DNA复制起始和多种压力应激的调控，但其在黄曲霉中的功能尚未见报道。本研究通过同源比对找到了abp2在黄曲霉中的同源基因，将其命名为abpB，通过融合PCR和DNA同源重组构建ΔabpB敲除菌株。表型分析结果显示，ΔabpB敲除株产孢能力下降，但孢子萌发率和形成的菌落直径明显超过野生型。此外，ΔabpB菌株不能形成菌核，也无法合成黄曲霉毒素，对DNA损伤修复胁迫无明显响应，但对氧化胁迫的敏感性降低，侵染花生子叶时的产孢和产毒能力下降。这些结果表明，abpB在黄曲霉孢子萌发和菌落生长中起抑制作用，对菌核形成和毒素合成起促进作用，参与氧化应激的调控。本研究揭示了AbpB在黄曲霉生长发育、毒素合成和氧化应激中的重要作用，为黄曲霉污染的防控提供基础资料和新的思路。
小热激蛋白(Hsp20s/sHsps)是生物体中一类具有分子伴侣活性的重要蛋白，在热胁迫响应中发挥关键作用。本研究通过生物信息学方法系统鉴定了六妹羊肚菌Morchella sextelata的Hsp20家族成员(MsexHsp20s)，并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化、保守基序、基因结构、蛋白三维结构及启动子顺式作用元件进行分析。同时，通过RT-qPCR检测了MsexHsp20s在高温胁迫下的表达模式。结果表明：六妹羊肚菌基因组中共鉴定出6个MsexHsp20s成员，蛋白质分子量介于16.60-27.15 kDa；亚细胞定位预测主要位于细胞核；系统进化分析显示其均匀分布于子囊菌门分支；启动子区域富含激素及非生物胁迫响应元件；RT-qPCR结果显示，除MsexHsp20-6外，其余5个基因在高温胁迫下均呈现显著差异表达，其中MsexHsp20-2和MsexHsp20-5在胁迫早期(1 h)表达量急剧上升超百倍，MsexHsp20-1则在胁迫后期(24 h)显著上调。本研究揭示了MsexHsp20s在六妹羊肚菌热胁迫响应中的重要作用，为解析羊肚菌耐热机制及抗逆育种提供了候选基因与理论依据。
磷酸葡萄糖变位酶(phosphoglucomutase, PGM)是调控香菇多糖合成的关键代谢枢纽。为阐明香菇PGM的酶学特性，本研究以香菇新808为材料，通过基因组比对，成功扩增出3个pgm基因(Lepgm1、Lepgm2和Lepgm3)。将3个pgm基因克隆并在大肠杆菌Rosetta (DE3)中进行了异源表达，经Ni-NTA亲和层析纯化获得重组蛋白。酶学性质分析表明，LePGM1、LePGM2和LePGM3的分子量分别为72.15、75.89和72.15 kDa。三者最适反应温度均为35 ℃，但最适pH存在差异：LePGM1为9.0，LePGM2和LePGM3均为8.0。动力学参数显示，三者对底物葡萄糖-1-磷酸的亲和力(Km值)存在差异，其中LePGM3的亲和力最高(Km=0.64 mmol/L)，LePGM1最低(Km=0.80 mmol/L)。本研究首次系统表征了香菇pgm基因家族的酶学特性，揭示了同工酶之间的功能分化，研究结果可为通过代谢工程策略优化香菇多糖的发酵合成提供重要的酶学与理论依据。
MYB转录因子是一类至关重要的转录调控因子，其高度保守的MYB结构域能够特异性结合靶基因启动子区域的顺式作用元件，从而精准调控下游基因的表达，在生物体的生长发育进程中扮演着不可替代的核心角色。目前，MYB基因家族已在许多植物、动物和一些真菌中被鉴定出来，但在具有重要经济价值的食用菌香菇Lentinula edodes中尚未被系统剖析。本研究基于香菇单核体菌株SP3的基因组数据，通过生物信息学方法共鉴定出11个含典型MYB结构域的成员(LeMYB1-LeMYB11)，并依据结构域数量将其划分为3类：LeMYB2、LeMYB5和LeMYB8为1R-MYB，LeMYB6和LeMYB7为2R-MYB，其余6个属于3R-MYB。表达谱分析揭示了该家族成员在发育与胁迫响应中的功能分化：LeMYB3、LeMYB4和LeMYB8在不同生长发育时期的表达丰度均较高，且在菌盖中的表达高于在菌柄中的表达；LeMYB1在菌丝期高表达，随发育进程显著下调；LeMYB8在成熟子实体中显著上调2.72倍。在非生物胁迫下，热激(35 ℃)诱导多数LeMYB上调，其中LeMYB1和LeMYB11在24 h分别上调12.9倍和3.8倍；过氧化氢处理则导致除LeMYB11外所有基因下调，LeMYB1下调达6.5倍；在自然老化过程中，仅LeMYB4在培养38 d后持续显著上调1.75倍。综上所述，香菇MYB转录因子家族在结构组成、表达动态及调控网络上呈现高度多样性，不仅参与子实体发育的时空调控，还在热激、氧化应激及衰老等非生物胁迫响应中扮演关键角色，为深入解析香菇环境适应机制及分子育种提供了重要候选基因资源。
本研究对刺孢马蒂菌Mattirolomyces spinosus和地菇状马蒂菌M. terfezioides进行了形态学与分子系统学鉴定，首次提供了M. spinosus在中国分布的凭证标本及其分子序列。营养成分分析表明，M. terfezioides粗蛋白(5.42%)与总氨基酸含量(10.22 g/kg)显著高于M. spinosus，后者水溶性多糖含量更高(107.88 mg/g)。两者子囊果共检出17种氨基酸，其中呈味氨基酸占比较高(均超过90%)，鲜甜味氨基酸贡献总体强于苦味氨基酸。电子舌分析结果显示两者均以鲜味为主，M. terfezioides甜味更突出，与其较高的甜味氨基酸含量一致。体外抗氧化实验表明，在1-5 mg/mL浓度范围内，两种供试真菌水溶性多糖的自由基清除能力随浓度升高而增强，且M. terfezioides多糖在ABTS自由基、DPPH自由基及羟基自由基清除体系中活性更强。本研究为我国马蒂菌属真菌的资源保护、营养评价与潜在功能开发提供了科学依据。
本研究以3株白灵侧耳栽培菌株为试验材料，通过测定其栽培过程中不同生长阶段木质纤维素降解酶的活性，深度分析其活性变化规律和胞外酶活性与农艺性状之间的相关性。结果揭示在相同栽培条件下，3株白灵侧耳菌株的4种胞外酶活性变化规律基本一致，但表现出明显的阶段性差异特性；其中羧甲基纤维素酶、滤纸纤维素酶和木聚糖酶活性在菌丝生长阶段缓慢上升，峰值出现在子实体成熟期，而漆酶活性则在菌丝生长期迅速升高，峰值出现在菌丝满袋时，子实体采收后酶活性均呈下降趋势。白灵侧耳子实体成熟时间与菌丝生长速度呈显著负相关，菌盖厚度、菌盖直径和子实体产量之间呈显著正相关，纤维素酶活性与现蕾时间呈显著负相关，滤纸纤维素酶、木聚糖酶活性与子实体形态和产量呈显著正相关，漆酶活性与菌丝生长速度互为显著正相关，滤纸纤维素酶与木聚糖酶具有协同作用。
本研究旨在明确灰树花Grifola albicans的最适培养条件，解析其在发酵过程中抗氧化活性和对培养基质酶系响应规律，研究结果为其栽培和高值化开发利用提供基础数据。本研究采用单因素试验和正交试验，测定了不同碳源、氮源、无机盐、pH及温度对灰树花菌丝体生长速率的影响，并且测定了液体发酵培养中胞外多糖与多酚含量、超氧化物歧化酶活性、总抗氧化能力及对1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl, DPPH)自由基、羟自由基和超氧阴离子的清除率；同时，以蒙古栎和青冈栎为基质，探究灰树花木质纤维降解酶系的活性差异。结果表明灰树花菌丝体在果糖、麦麸、MgSO4、25 ℃和pH 6条件下长势最优；发酵培养液具有较强的综合抗氧化潜力；在灰树花降解蒙古栎过程中，漆酶、滤纸纤维素酶和木聚糖酶活性峰值更高，而降解青冈栎则具有酶活性初期启动快、后期稳定性强的优势。
