The genus Scutellinia (Pyronemataceae) from China with a key to the known species of the country

Mycosystema ›› 2013, Vol. 32 ›› Issue (3) : 429-447.

PDF(34137 KB)
PDF(34137 KB)
Mycosystema ›› 2013, Vol. 32 ›› Issue (3) : 429-447.
Papers

The genus Scutellinia (Pyronemataceae) from China with a key to the known species of the country

Author information +
History +

Abstract

Recent collections and herbarium specimens of the genus Scutellinia from different regions of China were examined. Thirty-one species were recognized. Among them, S. neokorfiana, S. oblongispora and S. pseudovitreola are described as new species. The occurrence of S. erinaceus, S. olivascens (as S. lusatiae) and S. lusatiae in China are doubtful. Based on examinations of the related specimens, the previous Chinese records of S. barlae, S. superba and S. vitreola are based on mis-identifications, which should be excluded from the Chinese fungus flora. A key to the known species of the genus from the country is provided.

Cite this article

Download Citations
The genus Scutellinia (Pyronemataceae) from China with a key to the known species of the country[J]. Mycosystema, 2013, 32(3): 429-447
糙皮侧耳Pleurotus ostreatus (Jacq.) P Kumm.,俗称平菇,是全球广泛栽培的重要食用菌,因其极高的经济和营养价值而备受青睐(Ma et al. 2018;Özdemir et al. 2021;Effiong et al. 2024)。“雨后出蘑菇”这一自然现象揭示了水分在蘑菇形态转变中的关键作用,其对蘑菇子实体产量和品质具有重要影响。随着全球气候变化和环境压力的加剧,作为一种新兴农业生产方式,食用菌种植的产量和质量正面临严峻挑战(Bennett & Classen 2020;Kumar et al. 2021)。因此,深入研究糙皮侧耳对环境胁迫的适应机制显得尤为重要,不仅有助于提高栽培效率,还为开发更具环境适应性的食用菌新品种提供理论依据,从而保障食用菌产业的可持续发展。
水通道蛋白(aquaporins, AQPs)是一类高度保守的跨膜蛋白,主要负责选择性转运水分子及某些小分子溶质,如甘油、尿素和部分气体(Agre et al. 2002)。自1992年首次鉴定出水通道蛋白以来,AQPs已在植物、动物及微生物中被广泛鉴定和研究,显示出其在调节细胞内外水分平衡及响应环境胁迫中起着关键作用(Chevriau et al. 2024)。在真菌中,AQPs主要分为两类:经典水通道蛋白(aquaporin, AQP)和水-甘油通道蛋白(aquaglyceroporins, AQGP),它们均属于主要内在蛋白(MIPs)超家族,负责跨膜运输水和中性溶质(Tanghe et al. 2006;Verma et al. 2014)。已有研究集中在特定真菌中的AQPs功能,包括酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae (Xu & Zwiazek 2020)、代氏根霉Rhizopus delemar (Turgeman et al. 2016)、灰葡萄孢菌Botrytis cinerea (An et al. 2016)和沙漠松露Terfezia claveryi (Navarro-Ródenas et al. 2012)。如酵酒酵母中存在两类水通道蛋白:经典水通道蛋白(Aqy1和Aqy2)和水-甘油通道蛋白(Fps1和Yfl054) (Pettersson et al. 2005)。其中,Aqy1与孢子形成有关,而Aqy2则参与形态发生过程(Ahmadpour et al. 2014)。Fps1在酿酒酵母的渗透压调节中发挥核心作用,通过调控细胞内甘油的水平来适应不同的渗透压条件。在高渗透压条件下,其活性降低以保留甘油,而在低渗透压条件下则恢复活性以释放甘油(Tamás et al. 1999)。类似地,菌根真菌“沙漠松露”中的TcAQP1不仅能够转运水分,还能转运CO2,这一功能与其在半干旱环境中的适应性及其共生机制密切相关(Navarro-Ródenas et al. 2012)。
目前,关于丝状真菌AQPs的研究仍然有限,尤其是在糙皮侧耳中,尚未见到关于AQPs基因家族鉴定的报道,特别是AQPs在糙皮侧耳子实体发育及非生物胁迫中的作用尚未得到充分表征。
本研究通过生物信息学方法鉴定PoAQPs家族成员,并对其理化性质、亚细胞定位、染色体定位、系统进化关系、保守基序以及启动子顺式作用元件进行分析,最后利用RT-qPCR分析PoAQPs基因在不同生长阶段及水分过剩胁迫条件下的表达模式。该研究结果可为食用菌领域的AQPs研究提供新数据,同时对优化食用菌栽培管理、提升子实体产量及品质具有潜在的应用价值。

1 材料与方法

1.1 菌株、试剂和仪器

糙皮侧耳ATCC56271标准菌株取自上海市农业科学院食用菌研究所。TRIzol和cDNA反转录试剂盒[生工生物工程(上海)股份有限公司]、ABI 7300型荧光定量PCR仪(Thermo Fisher Scientific公司)。

1.2 样品处理

按照87%棉籽壳、12%麸皮和1%石灰的配方制作出菇栽培料,水分含量控制在60%,pH 7.0-7.5。每个组培瓶分装50 g培养料,121 ℃高压灭菌3 h后,置于超净工作台中接入等量糙皮侧耳二级种菌块,放入25 ℃恒温培养箱中培养,待菌丝长满后移至出菇箱。在水分过剩胁迫处理中,将去离子水均匀等量倒入组培瓶中,确保水分完全浸没菌丝体,水浸处理时间设置为0、4、8和12 h,满足水浸时间后将水倒出。所有水浸操作均在无菌条件下进行,避免外源污染。对糙皮侧耳的菌丝、原基、幼小和成熟子实体阶段的样品进行取样,同时在不同水浸时间下对菌丝进行取样。所有样品均经过液氮速冻处理,并存放于-80 °C超低温冰箱中,以备后续实验使用。所有实验均设有3个生物学重复,以确保结果的可靠性和可重复性。

1.3 PoAQPs家族成员鉴定

从InterPro数据库(https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF00230/curation/)下载水通道蛋白AQPs (PF00230)家族的hmm文件,从Ensembel数据库下载糙皮侧耳的全基因组(GCA_000697685.1)、蛋白质、cds和GFF3数据文件。将糙皮侧耳全基因组蛋白文件与种子文件通过Tbtools软件中的simple HMM search构建的隐马尔可科夫模型进行比对,得到候选的糙皮侧耳蛋白质序列(Zeng et al. 2023)。随后从NCBI网站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)下载模式真菌AQPs同源序列,并使用BLAST工具进行比对。对HMMER和BLAST结果取交集,共得到5条PoAQPs蛋白序列。用CDD (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)鉴定保守结构域,每条蛋白都含有MIP超家族结构域。

1.4 PoAQPs家族成员的生物信息学分析

1.5 PoAQPs家族成员的系统进化分析

根据已经得到的5个蛋白序列,并结合多个已报道的真菌的水通道蛋白进行进化分析,构建系统发育树。使用MEGA11软件采用最大似然法对AQPs家族的蛋白序列构建系统进化树,Bootstrap设为1 000进行自检(Kumar et al. 2018)。使用在线工具iTOL v6 (https://itol.embl.de/)和Adobe Illustrator 2023软件美化进化树。

1.6 PoAQPs基因家族成员保守基序、染色体定位分析

通过MEME软件将蛋白序列转换成Mast- out文件,再用Tbtools软件(Chen et al. 2020)对motif进行可视化分析。使用TBTtools软件,输入全基因组的Gff3文件和5个AQPs蛋白序列ID,可视化得到PoAQPs的染色体位置分布。

1.7 PoAQPs顺式作用元件分析

通过Tbtools软件提取PoAQPs基因家族的前2 000 bp启动子序列,在Plantcare (http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html)中预测顺式作用元件,整理之后用Tbtools进行可视化。

1.8 RT-qPCR分析

为进一步解析PoAQPs基因家族各成员的功能,本研究采用RT-qPCR分析了5个PoAQPs基因在不同生长阶段及不同水分过剩胁迫时间下的表达模式。使用RNA提取试剂盒分别提取糙皮侧耳不同发育时期(菌丝体、原基、幼小子实体和成熟子实体)以及不同水分过剩胁迫时间(0、4、8和12 h)下的样本总RNA,按照试剂盒说明书反转录为cDNA。针对PoAQPs家族蛋白序列及内参基因设计了特异性引物(表1),利用荧光定量PCR仪进行扩增。根据扩增所得的Ct值,采用2-ΔΔCT法计算基因相对表达量(Jozefczuk & Adjaye 2011)。
Table 1 Specific primers for RT-qPCR of PoAQPs genes in Pleurotus ostreatus

表1 糙皮侧耳PoAQPs基因的RT-qPCR引物

基因ID
Gene ID
基因名称
Gene name
上游引物
Forward primer (5ʹ→3ʹ)
下游引物
Reverse primer (5ʹ→3ʹ)
KDQ32801 PoAQPs1 CCACGCGATCGACATCTTTG ATAATCCGCCGCGTAGGTAG
KDQ25901 PoAQPs2 TGGTGCCGCTTTGGTCTAC AAAGAGCCCAGCAGTGTTC
KDQ25940 PoAQPs3 CCGGTTGGAGTTGGGTTGAC CCCAGTACACCCAGTGATGTG
KDQ24900 PoAQPs4 CGGTGCGGCAATGAATACTG GCCAATACACCCAATGGTGC
KDQ28261 PoAQPs5 GGGCTCACACTCTTCGTTGG CGGGCCGAGCCAATAAATCC
β-actin ATCCACGAGACAACATACAAC GATAGAACCACCAATCCAAA

2 结果与分析

2.1 PoAQPs家族成员的鉴定及理化性质分析

结合HMM和BLAST比对分析,共鉴定出5条PoAQPs序列。CDD结构域分析结果显示,这些蛋白均具有典型的MIP结构域,将其依次命名为PoAQPs1-PoAQPs5。PoAQPs家族成员的理化性质分析表明(表2),家族成员的蛋白序列长度较为一致,介于173-277 aa之间;PoAQPs平均分子量为27.15 kDa,其中PoAQPs3的分子量最大,为29.72 kDa,PoAQPs4最小,为20.78 kDa;蛋白质等电点(pI)介于6.06 (PoAQPs1)-9.75 (PoAQPs4)之间;疏水性介于0.479 (PoAQPs5)-0.661 (PoAQPs4);亚细胞定位预测显示,PoAQPs均定位于细胞膜。
Table 2 Physicochemical properties of PoAQPs family members

表2 PoAQPs家族成员的理化性质

基因ID
Gene ID
基因名称
Gene name
蛋白序列长度
Protein length (aa)
分子量
Molecular
weight (kDa)
等电点
Isoelectric
point
疏水性
Hydrophobicity
亚细胞定位
Subcellular location
KDQ32801 PoAQPs1 249 26.775 28 6.06 0.600 细胞膜 Plasma membrane
KDQ25901 PoAQPs2 272 29.228 09 8.32 0.606 细胞膜 Plasma membrane
KDQ25940 PoAQPs3 277 29.724 69 9.40 0.637 细胞膜 Plasma membrane
KDQ24900 PoAQPs4 195 20.781 46 9.75 0.661 细胞膜 Plasma membrane
KDQ28261 PoAQPs5 173 29.218 93 6.58 0.479 细胞膜 Plasma membrane

2.2 PoAQPs家族成员二级和三级结构分析

PoAQPs中的二级结构占比大致相同 (表3),其中无规则卷曲占比最大(40.56%- 50.55%),其次是α-螺旋(34.44%-41.03%)和延伸链(15.02%-24.10%)。使用SWISS-MODEL成功预测了PoAQPs家族成员的三级结构 (图1)。这些蛋白的核心结构均由6个跨膜螺旋(TM1-TM6)组成,并由5个连接环(Loop A-E)连接,这种高度保守的结构在所有PoAQPs中均显著保留。所有5个PoAQPs蛋白均展示出典型的NPA基序(Asn-Pro-Ala),位于2个半螺旋(HB和HE)的N端之间,该基序可能是这些蛋白质功能的关键,尤其是水分子转运及选择性通透性。值得注意的是,PoAQPs2和PoAQPs5的细胞外C末端环(Loop E)较长,PoAQPs4展示了独特的Loop B延伸结构,PoAQPs1和PoAQPs4在TM4和TM5之间的相互作用更为紧密,这暗示它们可能存在不同的构象开关机制。
Table 3 Secondary structure analyses of PoAQPs in Pleurotus ostreatus

表3 糙皮侧耳PoAQPs二级结构分析

基因ID
Gene ID
基因名称
Gene name
α-螺旋(Hh)
Alpha helix (%)
无规则卷曲(Cc)
Random coil (%)
延伸链(Ee)
Extended strand (%)
KDQ32801 PoAQPs1 35.34 40.56 24.10
KDQ25901 PoAQPs2 35.66 42.28 22.06
KDQ25940 PoAQPs3 38.27 47.29 14.44
KDQ24900 PoAQPs4 41.03 41.03 17.95
KDQ28261 PoAQPs5 34.43 50.55 15.02
Fig. 1 Prediction of tertiary structure of the PoAQPs in Pleurotus ostreatus.

图1 糙皮侧耳PoAQPs三级结构预测

Full size|PPT slide

2.3 PoAQPs基因家族成员系统发育分析

为了明确糙皮侧耳AQP家族成员的进化关系,本研究结合多个已经报道的代表性真菌水通道蛋白序列进行系统发育树的构建。进化分析显示,糙皮侧耳的PoAQPs可分为2个亚类:经典水通道蛋白(AQP)和水-甘油通道蛋白(AQGP) (图2)。其中PoAQPs3、PoAQPs4和PoAQPs5聚类于经典的AQP亚类,表现出与其他真菌AQP高度保守的特征,表明其主要参与水分子选择性转运的功能;而PoAQPs1和PoAQPs2则属于AQGP亚类,与众多已知的甘油通道蛋白聚为一簇,暗示它们不仅具有转运水的功能,还可能在甘油及其他小分子溶质的转运过程中发挥重要作用。糙皮侧耳AQP的系统发育分析为进一步理解糙皮侧耳水通道蛋白的多样性及其在环境适应性中的特异性功能提供了重要的参考依据。
Fig. 2 Phylogenetic tree of AQPs in different species.

图2 不同物种AQPs系统进化树

Full size|PPT slide

2.4 PoAQPs家族成员Motif分析

通过使用MEME和TBTtools软件对糙皮侧耳PoAQPs进行Motif分析,共预测出8个Motif (Motif 1-Motif 8) (图3)。分析结果显示,每个PoAQPs蛋白序列中均包含Motif 2、Motif 3和Motif 5,表明这些Motif在糙皮侧耳PoAQPs中分布最广泛,保守性最强。亲缘关系较近的PoAQPs通常具有相似的Motif,反映了它们之间密切的亲缘关系。相比之下,Motif差异较大的PoAQPs往往分属不同的亚族,具有较远的亲缘关系,导致它们的蛋白质Motif数量和分布存在显著差异,如PoAQPs1和PoAQPs5。此分析揭示了糙皮侧耳AQPs家族中不同成员在结构上的保守性与多样性,为进一步研究其功能特性提供了重要线索。
Fig. 3 Conserved motif analyses of PoAQPs gene family members.

图3 PoAQPs基因家族成员的保守基序

Full size|PPT slide

2.5 PoAQPs染色体定位分析

PoAQPs家族成员的染色体定位分析发现(图4),5个PoAQPs分布于4条染色体上,包括Chr4、Chr8、Chr10和Chr11,且分布并不均匀。其中,Chr10上聚集了2个PoAQPs基因(PoAQPs2PoAQPs3),而其余染色体上均只定位了一个PoAQPs基因。PoAQPs基因家族的这种不均匀分布可能反映了基因复制或染色体重排在基因进化中的作用,尤其是Chr10上的多基因分布可能代表了相关功能基因的簇群现象,揭示了其在特定生物过程中的协同作用。这种分布格局的揭示为深入理解糙皮侧耳水通道蛋白基因的演化与功能调控提供了重要线索。
Fig. 4 Chromosomal location of PoAQPs genes.

图4 PoAQPs基因的染色体定位

Full size|PPT slide

2.6 PoAQPs家族成员顺式作用元件分析

PoAQPs基因启动子区的顺式作用元件分析揭示了其在基因转录调控及环境响应中的潜在功能。通过PlantCARE数据库对PoAQPs基因上游2 000 bp区域的顺式作用元件进行预测,共鉴定出12种不同类型的元件,包括光响应、水杨酸响应、脱落酸响应、厌氧诱导、细胞周期调控、低温响应、分生组织表达、参与缺氧特异性诱导、参与干旱诱导的MYB结合位点、昼夜节律控制、生长素响应以及MYBHv1结合位点元件(图5)。这些元件在PoAQPs基因的启动子区域内具有较高的一致性,表明这些基因家族成员可能通过多种生物途径共同调控糙皮侧耳的生长发育及对环境胁迫的应答。这些发现为进一步探索PoAQPs基因在不同环境条件下的调控机制提供了理论依据。
Fig. 5 Analyses of promoter cis-acting elements of PoAQPs gene family members in Pleurotus ostreatus.

图5 糙皮侧耳PoAQPs家族成员的启动子顺式作用元件分析

Full size|PPT slide

2.7 PoAQPs的表达分析

RT-qPCR分析显示,PoAQPs基因在不同生长阶段和水分过剩胁迫条件下的表达存在显著差异。在生长过程中,PoAQPs1PoAQPs2PoAQPs5的表达量逐渐增加,并在成熟子实体阶段达到最高峰(图6A)。相比之下,PoAQPs3的表达在整个发育过程中变化较小,仅在成熟子实体阶段显著上调。以上结果表明PoAQPs在糙皮侧耳子实体形成阶段发挥重要作用。 在水分过剩胁迫实验中(图6B),PoAQPs1PoAQPs2PoAQPs4PoAQPs5的表达量呈现出先升后降的趋势,并在8 h时达到峰值。尤其是PoAQPs5,在12 h时依然保持较高的表达水平,表明其在长期水分胁迫中的潜在适应性。相反,PoAQPs3的表达则呈现出先降后升再降的趋势,并在12 h时达到最低值。这些PoAQPs基因表达水平的变化可能反映了它们在调节细胞内外水势变化和维持细胞膨压中的关键作用,从而帮助调控细胞内的水分平衡,避免因水分过量导致的细胞损伤。总的来说,PoAQPs家族成员在糙皮侧耳不同生长发育阶段和水分过剩胁迫响应中的表达模式和功能表现出显著差异。这些结果为进一步探讨PoAQPs的生物学功能提供了关键线索。
Fig. 6 Analysis of PoAQPs gene expression patterns in Pleurotus ostreatus under different growth stages (A) and waterlogging stress (B). A: The relative expression levels of PoAQPs at different growth stages, with M, P, Y, and S representing the mycelium, primordium, young fruiting body, and mature fruiting body stages of Pleurotus ostreatus, respectively. B: The relative expression levels of PoAQPs under different waterlogging stress durations. Data are presented as the mean ± standard deviation (n=3). * Indicates significant differences between groups, with *, **, ***, and **** indicating significance levels of P<0.05, P<0.01, P<0.001, and P<0.000 1, respectively.

图6 糙皮侧耳不同生长阶段(A)及水分过剩胁迫(B)下PoAQPs基因的表达模式分析 A:不同生长阶段下PoAQPs的相对表达量,M、P、Y、S分别表示糙皮侧耳的菌丝体、原基、幼小子实体和成熟子实体阶段;B:不同水分过剩胁迫时间下PoAQPs的相对表达量. 数据为平均值±标准差(n=3),*表示组间有显著性差异,*、**、***和****分别表示在P<0.05、P<0.01、P<0.001、P<0.000 1水平上差异显著

Full size|PPT slide

3 讨论

在动植物和真菌中,AQPs不仅参与细胞水分的转运和维持细胞渗透压平衡,还在细胞应对外界环境变化、调节生长发育进程中起到重要作用(Maurel & Chrispeels 2001)。研究表明,过表达Aqy1Aqy2增强了酿酒酵母的冷冻耐受性(Tanghe et al. 2002);AQP8调节灰葡萄孢菌Botrytis cinerea的细胞发育和活性氧生成,并在致病过程中发挥重要作用(An et al. 2016)。由于基因组测序技术的快速发展,已经在很多真菌中鉴定出AQPs,如黑曲霉Aspergillus niger 7个(Laothanachareon et al. 2023)、木霉Trichoderma atroviride 7个(Amira et al. 2021)、灵芝Ganoderma lingzhi 5个(朱全宇 2022)、禾谷镰孢菌Fusarium graminearum 5个(丁明玉 2018),这些结果为AQPs在真菌生长发育、环境适应及水分调控等生物学功能的研究奠定了基础。本研究从糙皮侧耳基因组中成功鉴定出5个PoAQPs基因家族成员。系统发育分析将5个PoAQPs基因分为两大类:经典水通道蛋白(AQP)和水通道-甘油通道蛋白(AQGP),这种分类与在其他真菌中的报道一致,表明这些基因在真菌中的进化和功能具有一定的序列保守性(Chevriau et al. 2024)。进一步的Motif分析揭示了尽管这些基因的序列存在差异,但其保守的NPA基序可能决定了这些蛋白的基本功能,如水分子运输和选择性通透性(Törnroth-Horsefield et al. 2006)。PoAQPs基因启动子区域含有大量与非生物胁迫相关的调控作用元件,如低温响应和缺氧诱导,表明PoAQPs基因家族参与糙皮侧耳非生物胁迫过程。
MIP超家族结构域是水通道蛋白的关键特征,负责水分子在细胞膜上的高效选择性运输(Xiong et al. 2023)。该结构域的存在表明这些PoAQPs具有经典的水分运输功能,确保在不同环境条件下的水分平衡。同时,MIP超家族结构域的保守性也揭示这些蛋白在进化过程中保留了其核心功能,可能参与了糙皮侧耳对环境胁迫的响应和适应过程。PoAQPs在三级结构上具有显著保守性,尤其是6个跨膜螺旋和NPA基序(图1),而NPA基序的存在被认为是水通道蛋白能够高效选择性转运水分子的基础,阻止质子的通过(Murata et al. 2000;Hub & de Groot 2008)。这种结构的保守性支持了其在水分子转运中的核心功能,同时通过特定的电性环境维持选择性通透性。尽管PoAQPs成员在整体结构上表现出高度的保守性,但每个成员在关键区域的结构变异可能与其在不同发育阶段或环境胁迫下的功能分化有关。例如,PoAQPs2和PoAQPs5中细胞外C末端环较长的Loop E可能反映了其在环境胁迫中的特定功能,而PoAQPs4中独特的Loop B延伸结构可能赋予其特殊的分子识别或信号传导功能。这些结构上的差异揭示了这些蛋白质在应对不同环境条件和细胞功能需求时的功能多样性(Lee et al. 1997)。这些预测的结构不仅揭示了PoAQPs家族成员的功能多样性,还为未来的实验验证提供了重要的参考。
在糙皮侧耳的不同生长阶段及水分过剩胁迫条件下,PoAQPs基因的表达量和趋势不同。本研究发现,PoAQPs基因均在子实体阶段高表达,表明它们可能在子实体的形成和成熟中发挥重要作用,这与先前在其他真菌中观察到的AQPs基因在发育过程中的功能相一致。例如,AQPs在调控丝状真菌菌丝的生长、菌核和分生孢子的形成及孢子萌发方面发挥重要作用(Li et al. 2013;Nehls & Dietz 2014)。同时,AQPs还与次级代谢物的产生和分子运输过程有关(Turgeman et al. 2016;Ding et al. 2018)。这种现象可能源于AQPs在调控细胞膨压和水分运输中的关键作用,这对于维持真菌子实体的正常生长发育至关重要。在水分过剩胁迫条件下,PoAQPs1PoAQPs2PoAQPs4PoAQPs5的基因表达量呈先升后降的趋势,并在胁迫8 h达到峰值,其中PoAQPs5在胁迫12 h后依然保持高表达。类似的响应模式在其他真菌(如酿酒酵母)中也有报道,AQPs通过在不同环境中维持细胞内适应环境的渗透压,从而防止细胞脱水或过度膨胀(Benga 2009;Xu & Zwiazek 2020)。与此同时,AQPs在植物病原真菌和共生真菌中也扮演重要角色,其不仅影响真菌自身的生长,还通过调节水分运输来改变真菌与宿主植物的相互作用(Lu et al. 2023;Wang et al. 2024)。如丛枝菌根(AM)真菌可以通过调控共生植物桑树根系中PIPsTIPs家族基因的表达,促进桑树水分吸收和氮素利用(涂德辉等 2022)。
本研究通过生物信息学方法在糙皮侧耳基因组中鉴定出5个PoAQPs,系统发育分析显示5个PoAQPs属于2个不同的亚家族,均含有MIP超家族结构域和经典的AQPs三级结构特征。同时PoAQPs基因在糙皮侧耳不同生长阶段和不同水分过剩胁迫时间下存在差异性表达,表明PoAQPs在糙皮侧耳的子实体成熟及响应非生物胁迫中起到重要作用。研究结果为食用菌AQPs领域的研究提供了新的见解,为解析糙皮侧耳的水分调控分子机制和培育抗胁迫品种提供理论依据。未来,通过进一步的AQPs功能验证及更深入的环境适应性研究,有望更好地理解AQPs在真菌生态学中的作用,从而为食用菌栽培育种及产业发展提供潜在的新策略。

作者贡献

胡继鹏:设计和完成实验、分析数据、撰写和修改文稿;鲍大鹏:提供论文思路;邹根:指导实验;尚俊军:参与设计实验、指导论文写作;高贺宇:参与完成实验、分析数据;唐利华:指导实验和论文写作。

利益冲突

作者声明,该研究不存在任何潜在利益冲突的商业或财务关系。
PDF(34137 KB)

Accesses

Citation

Detail

Sections
Recommended

/