环状RNA是一类具有丰富调节潜力的闭合环状单链RNA,其可以通过竞争性结合内源RNA、充当蛋白质支架以及翻译模板等方式,从而参与基因表达调控。本文综述了真菌环状RNA的鉴定流程和难点,为后续解析环状RNA在真菌发育与代谢等过程中的调节作用提供理论支持。
通过形态学、解剖学、化学与分子系统学相结合的方法对采自巴音布鲁克自然保护区的地衣进行分类学研究,发现石鳞衣属地衣一新种——白缘石鳞衣Gypsoplaca albimarginata。新种的主要特征为地衣体具白色边缘、假根,子囊盘红褐色、镶嵌在鳞片表面。本研究对该种进行了详细的形态特征描述,并与其相似种进行了比较和讨论。
近年来,四川等地种植的六妹羊肚菌先后爆发柄腐病害,造成严重经济损失。本研究对该病害发生情况进行了调查,从四川、河南、甘肃、贵州4个省收集的12份六妹羊肚菌柄腐病子实体,分离纯化得到37株真菌和3株细菌。根据柯赫氏法则,对所有分离纯化得到的疑似病原菌进行了回接试验,最终确定GJB-3菌株为柄腐病的病原菌。经ITS、RPB2和EF1α序列分析,结合菌落形态和显微特征鉴定柄腐病的病原菌为Fusarium nematophilum。本研究为后期羊肚菌生产病害防控提供了有效的基础数据。
以湖南省林业科学院龙伏实验基地的3年生樟根生产（root production method,RPM）苗和同龄常规技术培育的苗木（以下简称常规苗）为研究对象,采集两种苗木的根系和根际土,观察根系上菌根形态,并对其苗木样品进行高通量测序研究,探索二者根系菌根特征及根系、根际土丛枝菌根真菌（arbuscular mycorrhizal fungi,AMF）群落结构及土壤微生境差异,旨在为进行接种有效性菌根苗木来改善常规苗木的土壤微生境,进而培育高质量苗木提供理论依据。结果显示：2种樟苗木根系均显示AM菌根特征,未见外生菌根结构。测序得到属于AMF群落的有效序列共25 738条,隶属1门,2纲,3目,5科,5属,按有效序列占比从高到低依次为Acaulospora、Glomus、Diversispora、Rhizophagus和Paraglomus。根生产法（RPM）苗和常规苗的优势属均为Acaulospora和Glomus,只是RPM苗中Glomus占比高（在根、根际土内占比分别为28.04%、57.36%）而常规苗中Acaulospora占比高（在根、根际土内占比分别为99.58%、42.2%）。2种苗木均是根际土内的丰富度指数（Ace和Chao）远高于根系,并且RPM苗根际土的丰富度指数高于常规苗,但二者根系内的丰富度指数无显著差异（P<0.05）。冗余分析结果显示,土壤pH和有效磷是决定AMF群落结构的主要影响因子。不同理化因子对AMF群落的菌属影响程度也不同。
本研究比较轮作和连作下滨海滩涂地绿花椰菜根际土壤真菌群落结构和多样性的变化特征,以探索不同轮作方式减缓绿花椰菜连作田连作障碍的效果。采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析单季稻-绿花椰菜水旱轮作、南瓜-绿花椰菜旱旱轮作和绿花椰菜连作3种耕作方式对绿花椰菜根际土壤真菌群落结构和多样性的影响。结果表明,在浙江省台州湾滨海滩涂地绿花椰菜种植区,水旱轮作、旱旱轮作和连作绿花椰菜根际土壤共获得11门、27纲、52目、94科、155属真菌。在门水平上相对丰度较高的为子囊菌门Ascomycota、油壶菌门Olpidiomycota、担子菌门Basidiomycota、接合菌门Zygomycota、壶菌门Chytridiomycota。与连作相比,轮作显著提高了绿花椰菜根际土壤中子囊菌门、壶菌门菌群的相对丰度,而以水旱轮作对其相对丰度的提高幅度更大。轮作显著降低了绿花椰菜根际土壤中油壶菌门、接合菌门菌群的相对丰度,而以水旱轮作对这2门菌群相对丰度的降低幅度更大。在属水平上轮作显著降低了绿花椰菜根际土壤中油壶菌属Olpidium、镰刀菌属Fusarium等的相对丰度,显著提高了绿花椰菜根际土壤中格孢腔菌属Pleospora的相对丰度,而水旱轮作更提高了格孢腔菌属的相对丰度,降低了油壶菌属、镰刀菌属的相对丰度。因此,轮作能改善台州湾滨海滩涂地上绿花椰菜根际土壤真菌群落结构,但水旱轮作更能增加绿花椰菜根际土壤真菌有益菌丰度,减少绿花椰菜根际土壤真菌有害菌群丰度,提高根际土壤真菌多样性指数,改良绿花椰菜根际土壤生态环境。
通过对5个香菇菌株重测序,以香菇L808-1菌株的全基因组序列为参考基因组,分析了这些菌株中插入/缺失（InDel）标记位点在香菇基因组10条染色体上的分布,并筛选了插入/缺失碱基数≥15的位点,合成了449对InDel标记引物。经过PCR和电泳检测,其中237对引物条带清晰。最终筛选出107个PIC≥0.3的标记作为核心InDel标记对来自国内的44份香菇菌株进行遗传多样性分析。聚类分析显示栽培菌株和野生菌株各自聚为一支,所选香菇菌株间存在明显的群体分层。群体结构分析显示香菇种质资源可分为4个亚群,主成分分析显示香菇菌株之间的位置及距离与聚类分析和群体结构分析结果相符。香菇InDel分子标记的开发与应用,为香菇核心种质的构建和种质资源育种引用提供了基础。
以捕食线虫真菌少孢节丛孢Arthrobotrys oligospora YMF 1.03170为研究材料,通过优化sgRNA 表达驱动体系 tRNAGly,构建CRISPR/Cas9基因编辑系统,成功获得基因定点编辑菌株。将该CRISPR/Cas9系统与同源重组相结合,可精确地对两个目的氨基酸编码基因同时进行定点置换。结合代谢图谱及前体化合物饲喂实验,发现6-甲基水杨酸合酶编码蛋白新的活性位点Arg17、Arg18、His33和His34。本研究将CRISPR/Cas9基因编辑系统应用在少孢节丛孢中,并成功建立基因编辑精细体系,为快速构建少孢节丛孢的遗传转化体系和研究该菌的基因功能提供有效方法。
羊肚菌属于子囊门真菌,是世界范围内最受欢迎的食用菌之一。本研究通过PacBio单分子实时测序技术对我国四川省成功栽培的六妹羊肚菌Morchella sextelata SCLS菌株进行全基因组测序,获得其高质量核基因组组装,大小为53.57Mb,重复序列含量为17.03%,包含42条重叠群（contigs）,重叠群N50高达1.82Mb,其中13条重叠群两端均含有端粒重复序列,为完整的染色体。通过链特异性RNA-seq测序和转录本拼接,并结合多种基因预测策略,预测到13 182个蛋白编码基因,包括267个碳水化合物活性酶,11个次生代谢产物合成基因簇。通过与内蒙古地区栽培的六妹羊肚菌菌株NZTD180501373基因组比较发现,六妹羊肚菌进化过程中可能发生过染色体重组事件,二者具有33 055个SNP和48 726个InDel位点差异,并且各自拥有超过6Mb的特有序列。此外,相比于梯棱羊肚菌M. importuna,六妹羊肚菌SCLS菌株中与逆转录转座酶有关的orthogroup发生了扩张,并且拥有5个成员数超过100的特有逆转录转座酶基因家族。对SCLS菌株中的DNA N6腺嘌呤甲基化（6mA）修饰进行了鉴定,发现SCLS菌株基因组中0.42%的腺嘌呤被6mA甲基化,其含量显著高于已报道的6种双核亚界（Dikarya）真菌。6mA甲基化位点在逆转录转座子上显著富集,表明六妹羊肚菌中6mA甲基化可能调控逆转录转座子的活性,这也是首次在真菌中报道6mA甲基化与转座子相关。
为探究9,10-环甲基十七烷酸（9,10-CMA）诱导灵芝三萜酸合成的相关信号机制,分析了NO信号的介导作用。结果表明,在NO信号分子介导下,9,10-CMA可有效地刺激灵芝菌丝体中三萜合成关键酶细胞色素CYP450和苯丙氨酸解氨酶（PAL）的活化以及三萜酸的合成。NO可作为灵芝菌丝体中CYP450产生和PAL活化的上游分子发挥作用。在9,10-CMA诱导下,通过荧光定量PCR分析了6个关键酶基因在灵芝三萜酸合成过程的动态表达。结果表明,在9,10-CMA诱导下与灵芝三萜酸合成相关的角鲨烯合成酶基因sqs、细胞色素P450单加氧酶CYP5150L8基因和3‐羟基‐3‐甲基戊二酰辅酶A还原酶基因hmgr的上调最显著,提示这3个酶在三萜诱导过程中具有重要作用。
通过实验室前期对诱变菌株猴头菌321的多组学分析结果,获得了一个多糖合成过程中起关键作用的UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因（UDP-glucose-4-epimerase,UGE）,并在大肠杆菌E. coli BL21（DE3）中进行了异源表达。通过筛选最优的目的蛋白诱导表达条件后,通过镍柱亲和层析纯化后获得高纯度目的蛋白,并对目的蛋白进行了酶学性质的研究,明确了其生物学性质和动力学参数,为其开发利用提供理论参考。
研究了稀土离子钇（Y3+）对栓菌Trametes sp. 菌株LS-10C发酵产漆酶的影响。结果表明,钇元素对该菌株发酵产漆酶有显著的促进作用,当培养基中Y3+浓度达到12mmol/L时,漆酶活力达到最高为70.25U/mL,是不添加Y3+发酵产漆酶活力的5.3倍。蛋白质组学研究结果表明,Y3+促进了细胞膜组分相关蛋白的表达上调,上调蛋白数占细胞组分富集上调蛋白总数的70.5%。此外在碳水化合物代谢,草酸代谢过程上调蛋白也有明显的富集。该研究明确了稀土元素Y3+对栓菌产漆酶的促进作用,并初步分析了稀土元素Y3+作用下栓菌Trametes sp. LS-10C的蛋白质组的变化规律,为研究稀土元素促进栓菌产漆酶的分子机理奠定了基础。
本研究通过农杆菌EHA105介导的方法,以含潮霉素抗性基因和GFP基因的双元载体pCAMBgfp为转化载体,对小孢拟盘多毛孢Pestalotiopsis microspora KFRD-2菌株进行遗传转化。基于潮霉素及GFP荧光抗性进行转化子的初步筛选,随后,进一步对转化子的菌落特征、菌丝生长速率、产孢量、荧光稳定性及致病力进行验证。结果获得阳性转化子100余株,转化效率达200个转化子/106个孢子。大部分转化子与野生型菌株无明显形态及致病力差异。同时,获得了14株菌丝形态、产孢量或致病力与野生型存在明显差异的突变株,可用于小孢拟盘多毛孢关键致病基因的挖掘验证及致病机理等研究。
本研究对38个不同批次和菌龄的椴木栽培鲍姆桑黄孔菌Sanghuangporus baumii子实体醇提物进行了高效液相色谱（HPLC）分析,建立了S. baumii醇提物HPLC指纹图谱,提取得到27个共有峰信息（P1-P27）;同时,对38个样品醇提取的Trolox等价抗氧化能力（TEAC）进行分析,基于正交偏最小二乘（OPLS）回归建立了抗氧化活性预测模型,潜变量数为3,交互验证所得累积模型预测参数（Q2）为0.803,变量累积解释指标（R2X）和（R2Y）分别为0.574和0.954,相关系数平方（R2）为0.954,经验证模型可以获得良好的预测效果,可以准确反映谱峰与活性之间相关关系;利用模型变量投影重要性（VIP）指标筛选得到14个共有峰对抗氧化活性具有显著贡献。研究获得的鲍姆桑黄孔菌抗氧化谱效关系模型为桑黄原料活性的预测提供了有效的方法,可辅助指导鲍姆桑黄孔菌活性化合物的分离纯化,也为鲍姆桑黄孔菌栽培子实体的品质控制提供了技术手段。
灵芝多糖是灵芝的主要药理活性成分之一。本研究通过检测血清指标分析灵芝子实体多糖（Ganoderma lingzhi fruitbody polysaccharides,GLFPS）对小鼠急性酒精性肝损伤的预防作用并结合代谢组学探究作用机制。结果显示,GLFPS显著抑制因酒精作用而升高的小鼠血清中ALT、AST、TG、TC和ADH水平。通过代谢组分析,在模型组与对照组中得到85个差异代谢物,其中三磷酸腺苷（adenosine triphosphate）、L-天门冬氨酸（L-aspartic acid）以及赖氨酸（L-lysine）等在相互作用网络中起重要作用,说明酒精能引起小鼠肝脏腺苷和氨基酸代谢的改变。GLFPS组与模型组有58个差异代谢物,主要包括脂质和有机氧化物,说明GLFPS可以通过调节小鼠肝脏中脂质与有机化合物代谢来预防急性酒精肝损伤。对差异代谢物进行KEGG富集分析发现主要涉及胆碱代谢、甘油磷脂代谢和ABC转运蛋白。GLFPS能够有效缓解这3个代谢通路中因酒精作用发生明显改变的代谢。综上可见,灵芝子实体多糖能够通过调节小鼠胆碱代谢、甘油磷脂代谢以及部分ABC转运蛋白有效预防酒精性肝损伤。
对妊娠第7-16天Wistar大鼠连续给予口服蝉棒束孢子实体低、中、高3个剂量（0.85、1.70、3.40g/kg）10d,观察给药组对大鼠孕期体重、死胎率、吸收胎率、活胎数、每窝平均胎仔数、胎鼠重、胎鼠身长、前囟宽度、子宫连胎重及胎鼠外观、内脏发育、骨骼发育的影响,研究妊娠动物接触蝉棒束孢子实体后引起的致畸可能性。对正常小鼠、STZ致高血糖模型小鼠给予口服不同剂量的人工培植蝉棒束孢子实体（0.4、0.25、0.125g/kg）,测定空腹血糖及糖耐量,评价蝉棒束孢子实体的降血糖作用。结果表明：与阴性对照组相比,人工培植蝉棒束孢子实体各剂量组在大鼠孕期体重、死胎率、吸收胎率、胎鼠重、胎鼠身长和前囟宽度、胎鼠外观、内脏和骨骼发育等方面均无显著性差异（P>0.05）;与模型对照组（0g/kg BW）相比,人工培植蝉棒束孢子实体中、低两个剂量组均能降低STZ致高血糖模型小鼠给葡萄糖后0.5h血糖水平（P<0.05）,低剂量组能明显降低高血糖模型小鼠0-2h血糖曲线下面积,且对小鼠体重及正常小鼠空腹血糖均无不良影响。提示人工培植蝉棒束孢子实体对大鼠无明显的母体毒性、胚胎毒性和致畸性;对高血糖小鼠具有降血糖的作用。
选用大球盖菇Stropharia rugosoannulata为试验材料,分析在镉胁迫处理下（2mg/L）添加不同浓度硒（0、6、15、20mg/L）对大球盖菇菌丝生长的影响,初步研究了施加硒对镉胁迫下大球盖菇菌丝生长抑制的缓解效应和作用机制。结果表明：镉对大球盖菇生长速度和生物量具有明显抑制作用,镉造成了大球盖菇渗透调节物质、过氧化氢和丙二醛含量显著增加;添加硒后,镉对大球盖菇菌丝的生长速度、生物量抑制作用均有所改善,且增加了渗透调节物质,促进镉胁迫下大球盖菇渗透调节能力;硒诱导抗氧化酶的活性上调,提高活性氧清除能力,降低了菌丝中丙二醛和过氧化氢的含量,缓解细胞膜过氧化程度,增强了大球盖菇对镉的耐受性。本研究重点探讨外源添加硒对镉胁迫下大球盖菇菌丝生长、生理特性及抗氧化胁迫能力的影响,为进一步研究硒在食用菌抗镉栽培中的应用奠定了一定的理论基础。
比较分析香菇球状菌株与正常菌株的形态特征、氨基酸特征和蛋白质品质,并基于现行国际氨基酸模式谱,采用蛋白质的氨基酸评分（amino acid score,AAS）、氨基酸比值系数分（ratio coefficient of amino acid,SRC）、IOM（Institute of Medicine）模式评分、化学评分（chemical score,CS）、必需氨基酸指数（essential amino acid index,EAAI）以及蛋白质校正氨基酸计分（protein digestibility corrected amino acids score,PDCAAS）多种指标进行评价。结果表明：与正常菌株相比,球状菌株形态上没有菌褶和菌柄的分化,同时营养成分也发生了变化,就粗蛋白含量而言,球状菌株为正常菌株的1.37倍（分别为32.32%和23.60%）;就平均总氨基酸含量而言,球状菌株（209.58mg/g）是正常菌株（163.10mg/g）的1.28倍。这些球状菌株的特征可作为新品种的培育材料进一步被利用。
多脂鳞伞是一种较为珍贵的药食用真菌。对其化学成分及体外抗肿瘤作用进行了研究。通过UPLC-QTOF-MS法、电喷雾离子源（ESI）及负离子全扫描模式测定了人工栽培多脂鳞伞的化学成分组成;体外培养HepG-2、A549、Hela及MCF-7,用不同质量浓度多脂鳞伞乙醇提物处理细胞,应用CCK-8法及流式细胞术进行细胞毒性测试,并应用流式细胞术选择HepG-2细胞系以进一步评估其对HepG-2细胞凋亡分析。结果表明：经UPLC-QTOF-MS分析,从多脂鳞伞子实体分析得到的化学成分与食药用菌成分数据库中的38种成分相吻合,其中棕榈酸与9E,12E-octadecadienoic acid含量最高,甾醇类化合物与多糖类化合物占比较高;多脂鳞伞乙醇提取物对HepG-2细胞毒性最强,其浓度为50μg/mL时凋亡率能够达到(23.71±1.59)%。多脂鳞伞具有多种功能性化学成分,并具有潜在的抗肿瘤应用价值,初步断定其抗肿瘤活性是功能性成分通过诱导细胞凋亡实现的。
研究不同剂量（100、200和400mg/kg）的牛樟芝水提物（WE）、醇提后水提取物（WEE）和醇提物（EE）对酒精诱导的ICR小鼠急性肝损伤的保护作用和对Nrf2/HO-1抗氧化信号通路的影响。研究结果表明：与模型组比较,400mg/kg的WE和WEE均能显著抑制血清ALT和AST水平的升高,200mg/kg的WE和WEE分别显著降低血清ALT和AST含量。各剂量的WE、WEE和EE均能显著降低肝脏MDA含量,200和400mg/kg的WE和不同剂量的WEE均可明显提高肝脏的SOD和CAT活力。H&E染色结果表明WE、WEE和EE对酒精诱导的肝损伤均有一定的改善作用,EE处理组的效果相对较差。免疫组化染色结果表明各剂量的WE、WEE和EE均能促进Nrf2的核转位,诱导HO-1的表达,提高肝脏的抗氧化能力,对酒精诱导的急性肝损伤具有明显的保护作用。提示牛樟芝能通过调节Nrf2/HO-1抗氧化信号通路发挥解酒保肝功效。
灵芝三萜是灵芝中主要的活性成分之一,前期研究发现油酸可以促进灵芝三萜液态深层发酵下的发酵合成。本研究主要对油酸促进灵芝三萜液态深层发酵的工艺进行优化,并进行3L发酵罐规模的验证。通过单因素实验考察油酸的添加方式、添加时间和添加浓度对灵芝三萜的影响,结合响应面实验,获得最优工艺条件并进行验证：在发酵第32h添加1.21%高温灭菌油酸,最高灵芝三萜含量为42.69mg/g;在发酵第7h添加1.35%过滤除菌油酸,最高三萜含量为43.38mg/g,分别比对照提高2.04倍和2.08倍。在1 000mL摇瓶中添加高温灭菌油酸和过滤除菌油酸,灵芝三萜含量分别为32.18和32.48mg/g,为对照的1.96倍和1.95倍;在3L发酵罐规模下灵芝三萜含量分别为28.66和25.13mg/g,为对照的1.62倍和1.42倍。本研究系统优化了油酸促进灵芝三萜液态深层发酵的工艺条件,并在与工业生产相对应的3L发酵罐上进行验证。该研究可为灵芝三萜的规模化发酵提供重要参考和借鉴。
奶油栓孔菌Trametes lactinea是一种生物活性丰富的大型真菌。本研究在单因素试验的基础上,通过响应面法优化其菌丝体多糖的提取工艺,利用DEAE-Cellulose-52阴离子交换柱和Sephadex G-200层析柱对粗多糖进行分离纯化,获得TLMPS-0、TLMPS-1和TLMPS-3均一多糖组分。采用化学组成分析、UV-vis、FTIR、刚果红实验对3种多糖组分进行结构分析,并检测了多糖清除自由基的能力和还原力。结果表明,奶油栓孔菌菌丝体多糖最优提取工艺为：提取温度99℃、料液比1:30 (g/mL)、提取时间5h,提取次数2次。在此工艺条件下,多糖提取率为4.01%。TLMPS-0、TLMPS-1和TLMPS-3的糖醛酸含量分别为12.91%±0.44%、8.24%±0.22%、7.50%±0.66%,硫酸基含量分别为22.24%±1.88%、14.55%±0.56%、18.68%±0.69%,并且证明TLMPS-0是一种α-吡喃型多糖或β-吡喃型多糖,而TLMPS-1是一种β-吡喃型多糖,均不具备三螺旋空间构象,此外,3种多糖组分均具有一定的清除DPPH自由基、ABTS自由基、羟基自由基的能力和铁离子还原能力,其中TLMPS-0抗氧化活性最强。研究结果为奶油栓孔菌多糖的功能研究与挖掘提供了研究基础与理论依据。
基于超高效液相-三重四级杆质谱联用（UPLC-MS/MS）定量检测法优化出一种灵芝三萜热回流提取的工艺。通过本实验建立的灵芝三萜UPLC-MS/MS精确方法检测不同来源的7个栽培品种灵芝子实体中19个三萜化合物的含量,筛选出三萜含量较高的sd-2灵芝子实体作为提取原料,以三萜含量和提取物得率为指标,通过单因素和响应面实验对灵芝三萜的热回流工艺进行优化,获得的最佳条件为：乙醇浓度75%、提取时间2.5h、液料比14:1、提取次数2次。对获得的最佳提取工艺进行中试实验,灵芝子实体乙醇提取物的得率为6.10%,三萜含量为11.8591mg/g。研究结果可为灵芝三萜的工业大规模提取提供理论依据,为灵芝高附加值产品的开发利用提供技术支撑。
本研究采用酸法、碱法、酶法和微波法对灵芝β-葡聚糖进行降解,通过降解率、产物分子量变化、产物聚合度分布等指标比较了不同方法的降解效果。结果表明,微波法降解率高达94%,处理后产物的分子量明显降低,寡糖产物聚合度分布广。酶法降解率约为40%,寡糖产物中含有DP2-5的成分。酸法及碱法降解率低于20%,寡糖产物少。研究表明,与其他3种方法相比,微波法降解率高、产物丰富、操作条件易于控制,是一种简单、高效的降解灵芝β-葡聚糖、制备灵芝β-葡寡糖的方法。
中国美味蘑菇Agaricus sinodeliciosus‘申美1号’品种是野生种人工驯化、选育而来。经过多年的示范栽培表明：‘申美1号’具有中温生长（菌丝生长23℃,出菇16-18℃）,产量较高（生物学效率50%）,菌龄较短（53d）,菇型圆整,菇质紧实,香味浓郁,遗传稳定性高等优良特性,适宜于中国美味蘑菇菌袋栽培模式,能够满足设施化栽培用种需求。
肺形侧耳‘杭秀2号’以‘台秀57’菌株为亲本采用多孢自交育种技术选育而成。该品种菌丝生长适温26-28℃,子实体生长发育适温22-28℃。菌盖扇形,深灰色,菌盖大小平均为4.38cm×3.65cm;菌柄圆柱形,白色,直径平均为1.06cm。鲜菇蛋白质含量2.94%,氨基酸总量2.54%。示范栽培表明,‘杭秀2号’平均生物学效率为71.2%。低温刺激后,经5-6d可完成一茬菇采收。该品种具有出菇整齐、商品性好等优良性状,适于设施栽培。
