新疆和陕西三叶草属根瘤菌16S rDNA多态性及系统发育研究

doi:10.11733/j.issn.1007-0435.2009.03.008

›› 2009, Vol. 17 ›› Issue (3): 304-309.DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2009.03.008

新疆和陕西三叶草属根瘤菌16S rDNA多态性及系统发育研究

吕飞, 蒋欣, 徐佳洁, 朱博, 韦革宏

西北农林科技大学生命科学学院, 陕西省农业分子生物学重点实验室, 陕西, 杨陵, 712100

收稿日期:2008-10-13 修回日期:2009-03-19 出版日期:2009-06-15 发布日期:2009-06-15
通讯作者: 韦革宏,E-mail:weigehong@yahoo.com.cn
作者简介:吕飞(1984- ),男,汉族,硕士研究生,研究方向为根瘤菌多样性,E-mail:destinylf@yahoo.com.cn
基金资助:
国家自然科学基金(30670372);科技部农业微生物菌种资源整理、整合及共享试点子项目(2005DKA21201)

16S rDNA Polymorphism and Phylogeny of Rhizobia Isolated from Trifolium in Xinjiang Uygur Autonomous Region and Shaanxi Province

LV Fei, JIANG Xin, XU Jia-jie, ZHU Bo, WEI Ge-hong

College of Life Sciences, Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture, Northwest A & F University, Yangling, Shaanxi Province 712100, China

Received:2008-10-13 Revised:2009-03-19 Online:2009-06-15 Published:2009-06-15

摘要/Abstract

摘要： 为阐明西北部分地区三叶草属(Trifolium L.)根瘤菌遗传多样性及系统发育地位,于2007年12月采用16S rDNA PCR-RFLP与16S rDNA全序列分析,对50株分离自新疆和陕西地区的三叶草属根瘤菌进行系统研究。结果表明:所有供试菌株产生了5种16S rDNA基因型,归属于根瘤菌属(Rhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)3个系统发育分支,表现出较为丰富的共生固氮体系多态性。其中,CCNWXJ0140在系统发育树中与三叶草叶杆菌模式菌株P.trifolii PETP02关系较近,序列相似性为98.9%,也扩大了可与三叶草形成共生关系的根瘤菌种类的范围。通过不同地区同一寄主的三叶草根瘤菌的比较,发现其共生关系因地理分布不同而具有多样性,因此,对于丰富三叶草根瘤菌资源及其开发利用具有重要意义。

关键词: 三叶草, 根瘤菌, 遗传多样性, 叶杆菌, 16SrDNA

Abstract: Little information was available about Trifolium rhizobia from the northwestern China.In order to investigate the genetic diversity of Trifolium rhizobia in Xinjiang Uygur Autonomous Region and Shaanxi province,fifty rhizobial strains isolated from Trifolium spp.were characterized based on 16S rDNA PCR-RFLP and sequencing analysis.Five genetic patterns of 16S rDNA were obtained and they belonged to Rhizobium,Agrobacterium,and Phyllobacterium through sequencing analysis of 16S rDNA,which revealed that Trifolium rhizobia had a higher diversity.In the phylogenetic tree of 16S rDNA,CCNWXJ0140 was closely related to genus Phyllobacterium and shared 98.9% sequence homology with Phyllobacterium trifolii PETP02.Comparing with previous studies,it had extended rhizobial species associated with Trifolium spp.Further analysis show these rhizobia didn’t have geographical specificity even if they were isolated from same host plant.Therefore,our study of Trifolium spp.symbionts is of value to rhizobial resource enrichment and application in agriculture.

Key words: Trifolium L., Rhizobia, Genetic diversity, Phyllobacterium, 16S rDNA

中图分类号:

S154.381

吕飞, 蒋欣, 徐佳洁, 朱博, 韦革宏. 新疆和陕西三叶草属根瘤菌16S rDNA多态性及系统发育研究[J]. , 2009, 17(3): 304-309.

LV Fei, JIANG Xin, XU Jia-jie, ZHU Bo, WEI Ge-hong. 16S rDNA Polymorphism and Phylogeny of Rhizobia Isolated from Trifolium in Xinjiang Uygur Autonomous Region and Shaanxi Province[J]. , 2009, 17(3): 304-309.

0
/ / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Ris|BibTeX

链接本文: https://manu40.magtech.com.cn/Jweb_cdxb/CN/10.11733/j.issn.1007-0435.2009.03.008

https://manu40.magtech.com.cn/Jweb_cdxb/CN/Y2009/V17/I3/304

参考文献

[1] 陈强,陈文新,张小平.省葛藤属根瘤菌的遗传多样性研究[J].中国农业科学,2004,37(11):1641-1646
[2] Woese C R.Bacterial evolution[J].Microbiol.Mol.Biol.Rev.,1987,51:221-271
[3] 姚竹云,陈文新.多相分类技术在根瘤菌分类中的应用[J].农业生物技术学报,1998,6(2):161-165
[4] 张贤,张英俊,吴维群.白三叶RAPD分析条件优化[J].草地学报,2006,14(3):219-220
[5] 韦革宏,刘虎岐,孙科技,等.河南省豆科植物根瘤菌表型多样性研究[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2002,30(3):71-75
[6] 谭志远,牛天贵,陈文新.天山根瘤菌(R.tianshanense)模式菌株16S rDNA全序列测定及其系统发育[J].高技术通讯,1997,(1):5-8
[7] Terefewor Z,Kaijalaines S,Lindstrom K.AFLP fingerprinting as a tool to study the genetic diversity of Rhizobium galegae isolated from Galega orientalis and Galega officinalis[J].J.Biotechnol.,2001,91(2-3):169-180
[8] 闫爱民,陈文新.三个根瘤菌新亚群的16S rDNA-RFLP分析[J].高技术通讯,1998,8(9):50-54
[9] Selenska P S,Evguenieva H E,Radeva G,et al.Characterization of Rhizobium'hedysari'by RFLP analysis of PCR amplified rDNA and by genomic PCR fingerprinting[J].J.Appl.Bacteriol.,1996,80:517
[10] Thomoson J D,Gibson T J,Plewniak F.The Clustal X windows interface:flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tool[J].Nucleic Acids Res.,1997,24:4867-4882
[11] Van de Peer Y,De Wachter R.Treecon for Windows:a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft windows environment[J].Comput.Appl.Biosci.,1994,10:569-570
[12] Saitou N,Masatoshi N.The neighbor-joining method:a new method for reconstructing phylogenetic tree[J].Mol.Biol.Evol.,1987,4(4):406-425
[13] 谭志远,陈文新.根瘤菌新类群代表菌株的16S rDNA全序列测定及其系统发育地位[J].微生物学报,1997,37(6):411-416
[14] 刘晓云,陈文新.三叶草、猪屎豆和含羞草植物根瘤菌16S rDNA PCR-RFLP分析和数值分类研究[J].中国农业大学学报,2003,8(3):1-6
[15] Pueppke S,Broughton W J.Rhizobium sp.strain NGR234 and Rhizobium fredii USDA257 share exceptionally broad,nested host ranges[J].Mol.Plant-Microbe Interact.,1999,12(4):293-318
[16] Jill M S,Heather H W,Matthew A P.Nonrandom genotypic associations in a legume-Bradyrhizobium mutualism[J].Evolution,1996,50(1):146-154
[17] Mhamdi R,Mrabet M,Laguerre G,et al.Colonization of Phaseolus vulgaris nodules by Agrobacterium-like strains[J].Can.J.Microbiol.,2005,51:105-1111
[18] Angel V,Encarna V,Fernandoz-Sontos F,et al.Phyllobacterium trifolii sp.Nov.,nodulating Trifolium and Lupinus in Spanish soils[J].Int.J.Syst.Evol.Microbiol.,2005,55:1985-1989

新疆和陕西三叶草属根瘤菌16S rDNA多态性及系统发育研究

16S rDNA Polymorphism and Phylogeny of Rhizobia Isolated from Trifolium in Xinjiang Uygur Autonomous Region and Shaanxi Province

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	牟丹, 杨帆, 卡着才让, 祁学忠, 顾智辉, 谢久祥, 李希来. 高加索三叶草响应不同降温模式低温胁迫的代谢组学分析[J]. 草地学报, 2021, 29(9): 1877-1884.
[2]	马骢毓, 韩重阳, 马赛男, 李旭旭, 蔡家邦, 汪阳, 张新全, 聂刚. 基于SSR分子标记的13个白三叶(Trifolium repens L.)品种指纹图谱构建[J]. 草地学报, 2021, 29(9): 1892-1899.
[3]	罗铭欣, 刘凤民, 陈纪言, 崔均涛, 张伟丽. ⁶⁰Coγ辐射柱花草M₃代的农艺性状及遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2021, 29(9): 1992-2000.
[4]	梁小玉, 季杨, 胡远彬, 易军, 白史且, 张靓, 张新全. 菊苣EST-SSR分子标记开发及通用性分析[J]. 草地学报, 2021, 29(9): 2081-2090.
[5]	牟丹, 马戈亮, 卡着才让, 李宗仁, 忠克吉, 谢久祥, 李希来. 不同降温模式下高加索三叶草的转录组比较分析[J]. 草地学报, 2021, 29(7): 1386-1396.
[6]	刘凌云, 范希峰, 滕珂, 岳跃森, 常智慧, 武菊英. 苔草属植物遗传多样性研究进展[J]. 草地学报, 2021, 29(6): 1148-1157.
[7]	张旭辉, 马绍英, 马蕾, 杨宁, 王娜, 张维霞, 连荣芳, 李胜, 柴强. 接种根瘤菌对重茬豌豆植株生长及光合特性的影响[J]. 草地学报, 2021, 29(6): 1234-1241.
[8]	李鹏珍, 赵得琴, 邓波, 杨军, 赵国华, 赵亮. 生物炭与干旱胁迫对接种紫花苜蓿光合效率及生长的影响[J]. 草地学报, 2021, 29(6): 1257-1264.
[9]	陈志祥, 罗小燕, 李拴林, 吴如月, 王文强, 丁西朋. 基于SSR标记的木豆种质资源遗传多样性与群体结构分析[J]. 草地学报, 2021, 29(5): 904-911.
[10]	潘越, 周冀琼, 郭川, 杨喆, 刘琳, 闫艳红, 赵艳兰, 刘珊, 孙飞达. 丛枝菌根真菌与根瘤菌对3种豆禾混播植物种间互作的影响[J]. 草地学报, 2021, 29(4): 644-654.
[11]	梁国玲, 刘文辉, 马祥. 590份皮燕麦种质资源穗部性状遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2021, 29(3): 495-503.
[12]	张琦, 魏臻武, 闫天芳, 耿小丽. 燕麦种质资源农艺性状遗传多样性的鉴定评价[J]. 草地学报, 2021, 29(2): 309-316.
[13]	安明珠, 韩博, 姜华, 段新慧, 文亦芾, 周凯. 鸭茅物种起源与系统发育分析研究进展[J]. 草地学报, 2021, 29(12): 2637-2644.
[14]	韦兴迪, 曾庆飞, 韦鑫, 李亚娇, 欧二绫, 刘正书. 贵州岩溶山区多花木蓝根瘤菌及高效菌株筛选[J]. 草地学报, 2021, 29(11): 2413-2421.
[15]	黄荣, 姚博, 王晓芬, 德吉卓玛, 吴菁菁, 张振粉. CQ10-LPSp对紫花苜蓿幼苗内生细菌多样性及其根瘤菌的影响[J]. 草地学报, 2021, 29(10): 2126-2134.