钝叶草种质资源分子标记开发及遗传多样性研究

doi:10.11733/j.issn.1007-0435.2025.04.004

草地学报 ›› 2025, Vol. 33 ›› Issue (4): 1039-1047.DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2025.04.004

• 研究论文 • 上一篇

钝叶草种质资源分子标记开发及遗传多样性研究

黄春琼, 张瑜, 王文强, 董荣书, 杨虎彪, 刘国道

1. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点实验室, 海南海口 571101

收稿日期:2024-06-19 修回日期:2024-08-16 发布日期:2025-04-28
通讯作者: 黄春琼,E-mail:huangchunqiong44@163.com
作者简介:黄春琼（1982-），女，汉族，云南宣威人，博士，研究员，主要从事热带草种质资源与育种研究，E-mail： huangchunqiong44@163.com
基金资助:
海南省自然科学基金（323RC536、322RC770）；国家现代农业产业技术体系（CARS-34）资助

Development of Molecular Markers and Study of Genetic Diversity of Stenotaphrum helferi Accessions

HUANG Chun-qiong, ZHANG Yu, WANG Wen-qiang, DONG Rong-shu, YANG Hu-biao, LIU Guo-dao

1. Tropical Crops Genetic Resources Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences/Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement in Southern China, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Haikou, Hainan Province 571101, China

Received:2024-06-19 Revised:2024-08-16 Published:2025-04-28

摘要/Abstract

摘要： 为了研究不同地理来源钝叶草种质资源间的遗传差异，本研究以13份来自不同国家的钝叶草种质资源为研究对象，利用SRAP标记对其进行遗传多样性分析。结果表明：从100对引物组合中筛选出了21对有多态性条带、且扩增条带清晰稳定的引物。利用这些引物对钝叶草种质进行扩增，共扩增获得161条条带，且均是多态性条带，多态性百分率为100.00%，平均一对引物能检测到7条条带，扩增范围为4~10条。遗传相似性系数为0.4805~0.9286，平均值为0.6452。利用UPMAG法在遗传相似性系数为0.6930时将13份钝叶草种质分为4个类群。主成分分析可将其分为5个类群。本研究结果表明13份钝叶草种质资源的遗传多样性处于上等水平，SRAP标记能有效地评价钝叶草种质的遗传差异，为钝叶草种质的开发利用提供依据。

关键词: 钝叶草, SRAP, 分子标记, 遗传多样性

Abstract: To study the genetic differences of Stenotaphrum helferi Munro ex Hock. F. from different geographical sources， 13 S. helferi accessions from different countries were used to analyze their genetic relationship by using PCR-based SRAP （Sequence related amplified polymorphism） molecular markers in this study. The results showed that 21 primer pairs from the original 100 primer pairs were selected based on the polymorphism， clarity and reproducibility of the bands. A total of 161 bands were amplified by 21 primer pairs from 13 accessions with an average of 7 bands per primer pair， and 161 （100.00%） out of them were polymorphic. The genetic similarity co-efficient （GSC） among the 13 accessions ranged from 0.4805 to 0.9286 with an average of 0.6452. Cluster analysis conducted by the unweighted pair-group method with arithmetic average （UPGMA） separated the 13 accessions into 4 groups when the genetic similarity coefficient was 0.6930. Principal component analysis divided the 13 accessions into 5 groups. The results indicated that the genetic diversity of S. helferi accessions was rich， which laid a foundation for the identification and evaluation of S. helferi accessions and molecular marker-assisted breeding.

Key words: Stenotaphrum helferi, SRAP, Molecular makers, Genetic diversity

中图分类号:

S543.9

黄春琼, 张瑜, 王文强, 董荣书, 杨虎彪, 刘国道. 钝叶草种质资源分子标记开发及遗传多样性研究[J]. 草地学报, 2025, 33(4): 1039-1047.

HUANG Chun-qiong, ZHANG Yu, WANG Wen-qiang, DONG Rong-shu, YANG Hu-biao, LIU Guo-dao. Development of Molecular Markers and Study of Genetic Diversity of Stenotaphrum helferi Accessions[J]. Acta Agrestia Sinica, 2025, 33(4): 1039-1047.

0
/ 收藏文章 0 / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Ris|BibTeX

链接本文: https://manu40.magtech.com.cn/Jweb_cdxb/CN/10.11733/j.issn.1007-0435.2025.04.004

https://manu40.magtech.com.cn/Jweb_cdxb/CN/Y2025/V33/I4/1039

参考文献

[1] 杨娟. 遮荫对钝叶草属植物形态与生理的影响[D]. 海口：海南大学，2020：6
[2] 黄娟，夏汉平，杨冰冰. 一种新的暖季型草坪草—钝叶草[J]. 草原与草坪，2004，2：61-62
[3] KIMBALL J A，TUONG T D，ARELLANO C，et al. Linkage analysis and identification of quantitative trait loci associated with freeze tolerance and turf quality traits inSt. Augustinegrass[J]. Molecular Breeding，2018，38（5）：1-16
[4] 卢雪琴，夏汉平，彭长连. 淹水对5种禾本科植物光合特性的影响[J]. 福建林学院学报，2004，24（4）：374-378
[5] 黄娟，夏汉平，蔡锡安. 遮光处理对三种钝叶草的生长习性与光合特性的影响[J]. 生态学杂志，2006，25（7）：759-764
[6] 葛晋纲. 高羊茅和钝叶草对干旱胁迫的适应性及生理响应[D]. 南京：南京农业大学，2004：13
[7] WANG Z Y，RAYMER P B，CHEN Z. Isolation and characterization of microsatellite markers for Stenotaphrum Trin. Using 454 sequencing technology[J]. HortScience，2017，52（1）：16-19
[8] YU X W，KIMBALL J A，MILLA-LEWIS S R. High density genetic maps of St. Augustinegrass and applications to comparative genomic analysis and QTL mapping for turf quality traits[J]. BMC Plant Biology，2018，18（1）：1-12
[9] 罗瑛. 钝叶草种质资源遗传多样性研究及评价[D]. 海口：海南大学，2018：7
[10] 傅荣昭，李文彬. DNA分子诊断技术在植物研究中的应用[J]. 高技术通讯，1994，4（2）：37-40
[11] YANESHITA M，KANEKO S，SASAKUMA T. Allotetraploidy of Zoysia species with 2n=40 based on a RFLP genetic map[J]. Theoretical and Applied Genetics，1999，98（5）：751-756
[12] GRATTAPAGLIA D，SEDEROFF R. Genetic linkage maps of Eucalyptus grandis and Eucalyptus urophylla using a pseudo-testcross： Mapping strategy and RAPD markers[J]. Genetics，1994，137（4）：1121-1137
[13] 郭海林，刘建秀，高鹤，等. 结缕草属优良品系SSR指纹图谱的构建[J].草业学报，2007，16（2）：53-59
[14] WU Y G，GUO Q S，HE J C，et al. Genetic diversity analysis among and within populations of Pogostemon cablin from China with ISSR and SRAP markers[J]. Biochemical Systematics and Ecology，2010，38（1）：63-72
[15] FERRIOL M，PICÓ B，NUEZ F. Genetic diversity of a germplasm collection of Cucurbita pepo using SRAP and AFLP markers[J]. Theoretical and Applied Genetics，2003，107（2）：271-282
[16] MILLA-LEWIS S R，ZULETA M C， VAN ESBROECK G A，et al. Cytological and molecular characterization of genetic diversity in Stenotaphrum[J]. Crop Science，2013，53（1）：296-308
[17] KIMBALL J A，ZULETA M C，MARTIN M C，et al. Assessment of molecular variation within ‘raleigh’ St. Augustinegrass using amplified fragment length polymorphism markers[J]. Hortscience，2012，47（7）：839-844
[18] LI G，QUIROS C F. Sequence-related amplified polymorphism （SRAP）， a new marker system based on a simple PCR reaction： its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theoretical and Applied Genetics，2001，103（2）：455-461
[19] 任羽，王得元，张银东. 相关序列扩增多态性（SRAP）一种新的分子标记技术[J]. 中国农学通报，2004，20（6）：11-13，22
[20] 樊洪泓，李廷春，邱婧，等. 石斛属几种植物遗传关系的SRAP和RAPD比较分析[J]. 中草药，2010，41（4）：627-63
[21] 陈丽静，潘刚刚，何晶，等. 用SRAP分子标记鉴定玉米自交系的遗传多样性[J]. 四川农业大学学报，2009，27（2）：148-152
[22] 郑轶琦，宗俊勤，薛丹丹，等. SRAP分子标记在假俭草杂交后代真实性鉴定中的应用[J]. 草地学报，2009，17（2）：135-140
[23] 叶刚，张笑笑，陈静波，等. 结缕草属植物杂交后代形态特征和SRAP分子标记鉴定[J]. 草地学报，2021，29（7）：1406-1415
[24] 刘燕，汪毅，马晶晶，等. 海雀稗SRAP-PCR分子标记体系优化及引物筛选[J]. 草地学报，2016，24（5）：1080-1086
[25] WANG Z，LIAO L，YUAN X，et al. Genetic relationships of bermudagrass （Cynodon dactylon var. dactylon） from different countries revealed by sequence-related amplified polymorphism （SRAP） analysis [J]. African Journal of Biotechnology，2011，10（75）：17106-17115
[26] ZHANG X X，LI J J，KAI Wet al. Morphological characteristics and SRAP analysis of bermudagrass mutants generated by 60 Co-γ radiation[J]. Journal of Radiation Research and Applied Sciences，2020，13（1）：657-664
[27] HUANG C Q，LIU G D，BAI C J，et al. Genetic analysis of 430 Chinese Cynodon dactylon accessions using sequence-related amplified polymorphism markers[J]. International Journal of Molecular Sciences，2014，15（10）：19134-19146
[28] 凌瑶，任秀梅，张新全，等. 野生狗牙根种质资源遗传多样性AFLP与SRAP联合分析[J]. 中国草地学报，2014，36（2）：85-92
[29] 邹枚伶，夏志强，吉家敏，等. 白木香SRAP-PCR反应体系的建立[J]. 基因组学与应用生物学，2009，28（1）：137-140
[30] 黄春琼，刘国道. 3种暖季型草坪草基因组DNA的提取方法[J]. 中国农学通报，2009，25（18）：417-419
[31] BUSEY P. Wilt avoidance in St. Augustinegrass germplasm[J]. HortScience，1996，31（7）：1135-1138
[32] BUSEY P，BROSCHA T K，CENTER B J. Classification of St. Augustinegrass[J]. Crop Science，1982，22（3）：469-473
[33] 叶绣珍，徐向明，李煜，等. 偏序钝叶草（Stenotaphrum secundatum）与地毯草（Axonopus compressus）营养器官特点的研究[J]. 热带亚热带植物学报，1995，3（3）：50-55
[34] 杨虎彪，李晓霞，虞道耿，等. 海南具C₄、C₃ 解剖特征的禾本科植物[J]. 植物学报，2011，46（4）：456-469
[35] 张延辉，李江华，孙强，等. 106份狗牙根材料的SRAP分析[J]. 草原与草坪，2013，33（2）：1-10
[36] 周莹洁，王显国，张新全. 野牛草种质基于SRAP标记的遗传多样性研究[J]. 草业科学，2011，28（11）：1930-1935
[37] 黄春琼，刘国道，白昌军，等. 结缕草属植物种质资源遗传变异研究[J]. 热带作物学报，2018，39（7）：1259-1265
[38] 宣继萍，周志芳，刘建秀，等. 结缕草属植物种间关系的SSR分析[J]. 西北植物学报，2008，28（2）：249-255
[39] 陈斐，魏臻武，李伟民，等. 基于SSR标记的苜蓿种质资源遗传多样性与群体结构分析[J]. 草地学报，2013，21（4）：759-768
[40] 陈志祥，罗小燕，李拴林，等. 基于SSR标记的木豆种质资源遗传多样性与群体结构分析[J]. 草地学报，2021，29（5）：904-911
[41] 伊然，王子玥，刘凌云，等. 基于EST-SSR标记的60份苇状羊茅遗传多样性分析[J]. 草地学报，2023，31（7）：2041-2048

编辑推荐 0

Metrics

阅读次数

全文

HTML			PDF

最新录用	在线预览	正式出版	最新录用	在线预览	正式出版
0	0	0	0	0	16

	来源	本网站

	次数	16
	比例	100%

摘要

最新录用	在线预览	正式出版

0	0	67

	来源	本网站

	次数	67
	比例	100%

钝叶草种质资源分子标记开发及遗传多样性研究

Development of Molecular Markers and Study of Genetic Diversity of Stenotaphrum helferi Accessions

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐 0

Metrics

本文评价

[1]	邹冰灿, 王霞, 张轩, 李玉玲, 黄艮晞, 黄琳凯, 张新全, 张海琴. 22份狼尾草属材料和1份芦竹属材料染色体数目及遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2025, 33(4): 1019-1028.
[2]	高慧霞, 梁云慧, 姚妙卓, 张鹏飞, 刘亚令. 蒙古黄芪全基因组SSR分子标记开发与居群遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2025, 33(3): 696-706.
[3]	聂豪杰, 程云龙, 包玉国, 朱林. 稗草种质资源形态性状遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2025, 33(2): 457-464.
[4]	周欣莹, 董彦娜, 邱玉鹏, 孙浩男, 刘亚伟, 李艳, 刘冬云. 基于叶绿体基因rbcL和trnL-F序列的河北省野生苔草属亲缘关系分析[J]. 草地学报, 2024, 32(9): 2728-2736.
[5]	孟帅, 范光宇, 赵治海, 段海峰, 刘贵河, 刘东霞. 181份谷子资源农艺性状分析[J]. 草地学报, 2024, 32(9): 2943-2951.
[6]	黄春琼, 何潇, 罗丽娟, 董荣书, 刘国道. 结缕草属种质资源EST-SSR遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2024, 32(8): 2386-2393.
[7]	张秀山, 祁娟, 孟祥君, 沈李瑜, 独双双, 杜旺毅, 路欣, 祁希明. 西北干旱区10份披碱草属种质表型遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2024, 32(8): 2531-2539.
[8]	汪阳, 闫三博, 张睿, 黄琳凯, 张新全, 聂刚. 白三叶杂交F1代群体的表型鉴定及SSR分析[J]. 草地学报, 2024, 32(6): 1657-1664.
[9]	常宏兵, 王晨, 何美敬, 曹熙敏, 俞凤芳, 曹晓良, 宋炜, 吕爱枝. 60份玉米种质资源遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2024, 32(4): 1162-1168.
[10]	陈彩锦, 王学敏, 刘文辉, 曾燕霞, 包明芳, 尚继红, 张尚沛, 朱新忠, 高婷, 崔峻岭, 张国辉, 陈志龙, 沙晓弟. 草种质资源遗传多样性研究进展[J]. 草地学报, 2024, 32(2): 349-357.
[11]	陈静波, 张笑笑, 李丹丹, 李建建, 王浩然, 刘建秀, 郭海林. 狗牙根诱变后代生长速度评价及DNA指纹图谱构建[J]. 草地学报, 2024, 32(2): 419-425.
[12]	杜柯, 黄伟业, 侯瑞虹, 高佳荷, 唐芳. 基于表型性状的花苜蓿遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2024, 32(12): 3733-3742.
[13]	贾艳艳, 邱玉鹏, 周欣莹, 耿宇航, 孙浩男, 刘冬云. 基于形态标记和ISSR分子标记的长瓣铁线莲遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2024, 32(1): 75-86.
[14]	王凤宇, 梁国玲, 刘文辉. 590份燕麦种质资源营养器官表型性状遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2024, 32(1): 158-167.
[15]	南彦斌, 许嘉诚, 何啟玥, 潘学能, 周渊涛. 青海草原毛虫转录组分析及SSR位点开发[J]. 草地学报, 2023, 31(9): 2653-2662.