两类SSR对苜蓿属种质遗传多样性和亲缘关系的比较研究

doi:10.11733/j.issn.1007-0435.2008.06.004

›› 2008, Vol. 16 ›› Issue (6): 559-565.DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2008.06.004

两类SSR对苜蓿属种质遗传多样性和亲缘关系的比较研究

杨占花¹, 魏臻武², 雷艳芳¹, 张丽芳¹

1. 甘肃农业大学草业学院, 兰州, 730070;
2. 扬州大学动物科学与技术学院, 扬州, 225009

收稿日期:2008-12-27 修回日期:2008-04-15 出版日期:2008-12-15 发布日期:2008-12-15
通讯作者: 魏臻武,E-mail:zhen-wu_wei@yahoo.com.cn
作者简介:杨占花(1983- ),女,青海乐都人,硕士研究生,研究方向为牧草遗传育种.
基金资助:
国家自然科学基金(30671486);甘肃省教育厅科学技术研究项目;甘肃农业大学草业生态系统教育部省部共建重点实验室基金

Identification of the Genetic Diversity and Relationship of Medicago Germplasms by Two Kinds of SSR Markers

YANG Zhan-hua¹, WEI Zhen-wu², LEI Yan-fang¹, ZHANG Li-fang¹

1. Pratacultural College, Gansu Agricultural University, Lanzhou, Gansu Province 730070, China;
2. College of Animal Science & Technique, Yangzhou University, Yangzhou, Jiangsu Province 225009, China

Received:2008-12-27 Revised:2008-04-15 Online:2008-12-15 Published:2008-12-15

摘要/Abstract

摘要： 利用33对细胞核SSR标记和28对叶绿体SSR标记对38份苜蓿属种质进行了遗传多样性和亲缘关系分析。在38份苜蓿属种质中,叶绿体SSR标记的平均等位变异数高于细胞核SSR标记,而遗传多样性指数则相反;分别用细胞核SSR、叶绿体SSR和61对SSR标记对38份苜蓿属种质进行聚类,结果显示:3次聚类都把38份苜蓿属种质划分为一年生和多年生苜蓿两个大类群;以相似系数0.8为准,3次聚类结果的差异主要显示在一年生苜蓿内部尤其是蒺藜苜蓿种质内的品种(系)划分上。

关键词: 多年生苜蓿, 一年生苜蓿, nuSSR, cpSSR, 遗传多样性

Abstract: The genetic diversity and kinship of 38 species of Medicago L.were analyzed using 33 nuSSR markers and 28 chloroplast microsatellites(cpSSR).In 38 species of Medicago L.,the average alleles of 28 chloroplast SSR markers was higher than 33 nucler SSR markers,while the genetic diversity index was opposite.The result of three clustering for 38 species of medicago L.using 33 nucleus SSR,28 chloroplast SSR,and 61 locus was as follows: three clustering separated all materials into two types,i.e.annual Medicago species and perennial Medicago species.Accessions of annual Medicago species were the more genetically diverse and contained larger number of regional special alleles,especially M.truncatula Gaertn.,than perennial Medicago species.

Key words: Perennial Medicago species, Annual Medicago species, nuSSR, cpSSR, Genetic diversity

中图分类号:

S812
S326

杨占花, 魏臻武, 雷艳芳, 张丽芳. 两类SSR对苜蓿属种质遗传多样性和亲缘关系的比较研究[J]. , 2008, 16(6): 559-565.

YANG Zhan-hua, WEI Zhen-wu, LEI Yan-fang, ZHANG Li-fang. Identification of the Genetic Diversity and Relationship of Medicago Germplasms by Two Kinds of SSR Markers[J]. , 2008, 16(6): 559-565.

0
/ / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Ris|BibTeX

链接本文: https://manu40.magtech.com.cn/Jweb_cdxb/CN/10.11733/j.issn.1007-0435.2008.06.004

https://manu40.magtech.com.cn/Jweb_cdxb/CN/Y2008/V16/I6/559

参考文献

[1] 毕玉芬.论苜蓿属植物遗传资源多样性及其保护问题[J].国外畜牧学-草原与草坪,1997,(4):1-5
[2] 卢欣石,何琪.中国苜蓿品种资源遗传多样性研究[J].中国草地,1997,(6):1-6
[3] 于林清,王照兰,萨仁,等.黄花苜蓿野生种群遗传多样性的初步研究[J].中国草地,2001,23(1):23-25
[4] 毕玉芬.北疆苜蓿属植物遗传多样性分析[J].草业科学,1998,15(3):13-18
[5] 魏臻武,曹致中.苜蓿品种特征特性及其遗传分子标记[A].见:中国草学会牧草遗传资源专业委员会编.新世纪牧草遗传资源研究[C].呼和浩特:内蒙古人民出版社,2003,157-167
[6] 魏臻武,盖钧镒.豆科模式植物蒺藜苜蓿基因组研究进展[J].中国草地学报,2006,(6):83-90
[7] Brummer E C,Bouton J H,Kochert G.Development of an RFLP map in diploid alfalfa[J].Theor.Appl.,1993,86:329-332
[8] Cregan P B,Bhagwat A A,Akkaya M S,et al.Microsatellite fingerprinting and mapping of soybean[J].Method.Mol.Cell.Biol.,1994,5:49-61
[9] Joshi S P,Gupta V S,Aggarwal R K,et al.Genetic diversity and phylogenetic relationship as revealed by inter-simple sequence repeat (ISSR) polymorphism in the genus Oryza[J].Theor.Appl.Genet.,2000,100:1311-1320
[10] 李拥军.苜蓿地方品种遗传多样性的研究-RAPD标记[J].草地学报,1998,(2):105-114
[11] 李拥军,苏加楷.中国苜蓿地方品种亲缘关系的研究-RAPD标记[J].草业学报,1999,(3):46-53
[12] 魏臻武.利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱[J].草业学报,2004,3:62-67
[13] Diwan N,Bhagwat A,Bauchan G,et al.Simple sequence repeat DNA markers in alfalfa and perennial and annual Medicago species[J].Genome,1997,40:887-895
[14] Ellwood S R,Souza N K,Kamphuis L G,et al.SSR analysis of the Medicago truncatula SARDI core collection reveals substantial diversity and unusual genotype dispersal throughout the Mediterranean basin[J].Theor.Appl.Genet.,2006,112:977-983
[15] 魏臻武,符昕,耿小丽,等.苜蓿遗传多样性和亲缘关系的SSR和ISSR分析[J].草地学报,2007,15(2):118-123
[16] 毕玉芬,车伟光,李季蓉.利用RAPD 技术研究弱秋眠性紫花苜蓿遗传多样性[J].作物学报,2005,32(5):647-652
[17] 蒿若超,张月学,唐凤兰.利用RAPD标记研究了53份苜蓿种质资源遗传多样性[J].草业科学,2007,24(8):69-73
[18] 刘志鹏,杨青川,呼天明,等.用SSR标记研究不同耐盐特性四倍体紫花苜蓿的遗传多样性[J].作物学报,2006,32(4):630-632
[19] Choi H K,Kim D,Uhm T,et al.A sequence-based genetic map of Medicago truncatula and comparison of marker colinearity with M.sativa[J].Genetics,2004,166(3):1463-1502
[20] Powell W,Morgante M,Doyle J J,et al.Genepool variation in genus Glycine subgenus Soja revealed by polymorphic nuclear and chloroplast microsatellites[J].Genetics,1996,144:793-803
[21] Mengoni A,Ruggini C,Vendramin G G,et al.Chloroplast microsatellite variations in tetraploid alfalfa[J].Plant Breed,2000,119(6):509-512
[22] Mengoni A,Gori A,Bazzicalupo M.Use of RAPD and microsatellite (SSR) variation to assess genetic relationships among populations of tetraploid alfalfa (Medicago sativa)[J].Plant Breed,2001,119:311-317
[23] 张丽芳,魏臻武,杨占花.蒺藜苜蓿SSR反应体系优化及在一年生苜蓿种质鉴定中的应用[J].草地学报,2007,15(5):429-436
[24] 海林,王克晶.半野生大豆种质资源SSR位点遗传多样性分析[J].西北植物学报,2002,22(4):751-757

两类SSR对苜蓿属种质遗传多样性和亲缘关系的比较研究

Identification of the Genetic Diversity and Relationship of Medicago Germplasms by Two Kinds of SSR Markers

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	马骢毓, 韩重阳, 马赛男, 李旭旭, 蔡家邦, 汪阳, 张新全, 聂刚. 基于SSR分子标记的13个白三叶(Trifolium repens L.)品种指纹图谱构建[J]. 草地学报, 2021, 29(9): 1892-1899.
[2]	罗铭欣, 刘凤民, 陈纪言, 崔均涛, 张伟丽. ⁶⁰Coγ辐射柱花草M₃代的农艺性状及遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2021, 29(9): 1992-2000.
[3]	梁小玉, 季杨, 胡远彬, 易军, 白史且, 张靓, 张新全. 菊苣EST-SSR分子标记开发及通用性分析[J]. 草地学报, 2021, 29(9): 2081-2090.
[4]	刘凌云, 范希峰, 滕珂, 岳跃森, 常智慧, 武菊英. 苔草属植物遗传多样性研究进展[J]. 草地学报, 2021, 29(6): 1148-1157.
[5]	陈志祥, 罗小燕, 李拴林, 吴如月, 王文强, 丁西朋. 基于SSR标记的木豆种质资源遗传多样性与群体结构分析[J]. 草地学报, 2021, 29(5): 904-911.
[6]	梁国玲, 刘文辉, 马祥. 590份皮燕麦种质资源穗部性状遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2021, 29(3): 495-503.
[7]	张琦, 魏臻武, 闫天芳, 耿小丽. 燕麦种质资源农艺性状遗传多样性的鉴定评价[J]. 草地学报, 2021, 29(2): 309-316.
[8]	安明珠, 韩博, 姜华, 段新慧, 文亦芾, 周凯. 鸭茅物种起源与系统发育分析研究进展[J]. 草地学报, 2021, 29(12): 2637-2644.
[9]	王建丽, 刘杰淋, 朱瑞芬, 钟鹏, 尤佳, 邸桂俐, 韩微波, 申忠宝. 28份籽粒苋种质资源的主要农艺性状遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2020, 28(4): 1050-1059.
[10]	杨艳婷, 石凤翎, 徐舶, 张雨桐, 闫伟. 苜蓿品种鉴定及其遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2020, 28(4): 1060-1067.
[11]	麻冬梅, 张喜斌, 黄婷, 王文静, 赵丽娟, 马巧利. 利用SSR标记对不同耐盐紫花苜蓿遗传多样性分析[J]. 草地学报, 2019, 27(6): 1477-1485.
[12]	刘亚令, 耿雅萍, 解潇冬, 王芳, 张鹏飞. 基于SSR分子标记的药用黄芪遗传多样性与遗传结构分析[J]. 草地学报, 2019, 27(5): 1154-1162.
[13]	邓振山, 李买平, 郝雷, 陈凯凯, 李静, 刘玉珍, 张宝宝, 齐向英. 巨菌草内生细菌多样性及其促生特性[J]. 草地学报, 2019, 27(5): 1213-1221.
[14]	徐振朋, 宛涛, 蔡萍, 张晓明, 伊卫东, 宛诣超. 裸果木种群遗传多样性特点及与地理气候因子关联研究[J]. 草地学报, 2018, 26(1): 70-76.
[15]	南铭, 赵桂琴, 柴继宽. 黄土高原半干旱区饲用燕麦种质表型性状遗传多样性分析及综合评价[J]. 草地学报, 2017, 25(6): 1197-1205.